24小时热门版块排行榜    

CyRhmU.jpeg
查看: 1906  |  回复: 7
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

chem虫虫

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助】关于卟啉衍生物的分子结构以及它在Hyperchem中的优化问题已有1人参与

哪位高手帮我看看这种卟啉衍生物的分子结构图:
TMPyP4:5, 10,15,20-Tetra(N-methyl-4-pyridyl)porphyrinc hloride,
            氯化 5 ,10 ,15 ,20 一四 一(N一甲基一4-吡啶基)卟啉,
我自己画了结构图,我想知道对着没,氯原子的连接位置是否正确。
还有我想知道,它在hyperchem中该用哪种方法优化?谢谢
回复此楼
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

chongchong11

至尊木虫 (著名写手)

Senior Engineer


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
就这么一个东东还得付费,,呵呵!!!
Nature+Science=Wisdom
8楼2010-07-25 21:54:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 8 个回答

yytsnake

至尊木虫 (职业作家)

yjcmwgk(金币+0,VIP+0):汗,你说我的id我也不拍你啊。上次吓着你啦?哈哈不好意思 10-28 12:34
用HYPERCHEM不好办,GAUSSIAN是常用于此的手段,某一版主是这方面的专家,不说ID是怕拍砖。
2楼2009-10-28 11:25:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主

★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lei0736(金币+3,VIP+0):谢谢 10-28 20:07
==gjf文件开始==
%mem=1000MB
# opt b3lyp/6-31g(d)

xx

4 1
N                  0.00000000   -2.04159837    0.00000000
N                  0.00000000    0.00000000   -2.10798627
N                 -0.00000000    2.04159837    0.00000000
N                  0.00000000    0.00000000    2.10798627
C                  0.01156068   -2.87508283    1.07265532
C                 -0.01156068   -2.87508283   -1.07265532
C                 -0.05045773   -1.11893948   -2.89498524
C                  0.05045773    1.11893948   -2.89498524
C                  0.01156068    2.87508283   -1.07265532
C                 -0.01156068    2.87508283    1.07265532
C                 -0.05045773    1.11893948    2.89498524
C                  0.05045773   -1.11893948    2.89498524
C                  0.03055524   -2.47751484    2.42687793
C                 -0.03055524   -2.47751484   -2.42687793
C                  0.03055524    2.47751484   -2.42687793
C                 -0.03055524    2.47751484    2.42687793
C                  0.01275988   -4.27402224    0.65468570
C                 -0.01275988   -4.27402224   -0.65468570
C                  0.01749021   -0.66412832   -4.25355505
C                 -0.01749021    0.66412832   -4.25355505
C                  0.01275988    4.27402224   -0.65468570
C                 -0.01275988    4.27402224    0.65468570
C                  0.01749021    0.66412832    4.25355505
C                 -0.01749021   -0.66412832    4.25355505
H                  0.03190019   -5.13050738    1.31294605
H                 -0.03190019   -5.13050738   -1.31294605
H                  0.07864025   -1.31451684   -5.11313182
H                 -0.07864025    1.31451684   -5.11313182
H                  0.03190019    5.13050738   -1.31294605
H                 -0.03190019    5.13050738    1.31294605
H                  0.07864025    1.31451684    5.11313182
H                 -0.07864025   -1.31451684    5.11313182
H                  0.00000000    0.00000000   -1.09315315
H                  0.00000000    0.00000000    1.09315315
C                  0.01285069    3.50374787    3.51780358
C                 -1.11750976    3.68398297    4.33021743
C                  1.12386918    4.33715144    3.72190427
C                 -1.13573643    4.66698800    5.32071199
H                 -1.98138659    3.04084747    4.18650848
C                  1.10581503    5.32091489    4.71128249
H                  2.00197041    4.21213224    3.09456262
H                 -2.01817214    4.78709027    5.94378523
H                  1.97441905    5.95898567    4.85161064
C                 -0.01285069   -3.50374787    3.51780358
C                  1.11750976   -3.68398297    4.33021743
C                 -1.12386918   -4.33715144    3.72190427
C                  1.13573643   -4.66698800    5.32071199
H                  1.98138659   -3.04084747    4.18650848
C                 -1.10581503   -5.32091489    4.71128249
H                 -2.00197041   -4.21213224    3.09456262
H                  2.01817214   -4.78709027    5.94378523
H                 -1.97441905   -5.95898567    4.85161064
C                  0.01285069   -3.50374787   -3.51780358
C                  1.12386918   -4.33715144   -3.72190427
C                 -1.11750976   -3.68398297   -4.33021743
C                  1.10581503   -5.32091489   -4.71128249
H                  2.00197041   -4.21213224   -3.09456262
C                 -1.13573643   -4.66698800   -5.32071199
H                 -1.98138659   -3.04084747   -4.18650848
H                  1.97441905   -5.95898567   -4.85161064
H                 -2.01817214   -4.78709027   -5.94378523
C                 -0.01285069    3.50374787   -3.51780358
C                 -1.12386918    4.33715144   -3.72190427
C                  1.11750976    3.68398297   -4.33021743
C                 -1.10581503    5.32091489   -4.71128249
H                 -2.00197041    4.21213224   -3.09456262
C                  1.13573643    4.66698800   -5.32071199
H                  1.98138659    3.04084747   -4.18650848
H                 -1.97441905    5.95898567   -4.85161064
H                  2.01817214    4.78709027   -5.94378523
Cl                -0.04646349    6.72903403    6.76276624
Cl                 0.04646349    6.72903403   -6.76276624
Cl                -0.04646349   -6.72903403   -6.76276624
Cl                 0.04646349   -6.72903403    6.76276624
N                 -0.02401552    5.48877157    5.51422905
N                  0.02401552    5.48877157   -5.51422905
N                 -0.02401552   -5.48877157   -5.51422905
N                  0.02401552   -5.48877157    5.51422905

==gjf文件结束==

自己下载一个高斯,算吧

[ Last edited by yjcmwgk on 2009-10-28 at 12:40 ]
3楼2009-10-28 12:38:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yjcmwgk

禁虫 (文坛精英)

密度泛函·小卒

优秀版主

引用回帖:
Originally posted by yytsnake at 2009-10-28 11:25:
用HYPERCHEM不好办,GAUSSIAN是常用于此的手段,某一版主是这方面的专家,不说ID是怕拍砖。

这个构型有D2对称性
如果保持对称性优化,Windows应该能算得动吧?
4楼2009-10-28 12:39:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复(可上传附件)
信息提示
请填处理意见