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关于结构优化中的对称性问题
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vigaryang
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关于结构优化中的对称性问题
如果要优化一个像NH3这种明确知道对称性的分子,是不是在优化时需要事先指定优化过程中对称性不变?如果是的话,是通过symmetry(pg=?)实现呢,还是在分子内坐标输入部分设置变量实现?网上查了一下,发现很难见到与symmetry(pg=?)这个命令有关的信息,不知是为什么。难道对于这种分子也不需要指定对称性吗,而任由其自由优化吗。谢谢。
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1楼
2011-05-23 04:42:32
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vigaryang
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引用回帖:
Originally posted by
zhangmt
at 2011-05-23 12:12:42:
Gaussian在优化的过程中,默认保持对称性不变。
也就是说,你的输入结构在gaussian读入之后,会首先做一个对称性判断,如果它判定为C3v了,那么,优化过程中,他就一直按照C3v来优化,如果按C3v优化不出来,他就 ...
学习了。我试了下添加symmetry(pg=?),发现对称性在计算前后反而比不添加时发生了更大的变化,诧异。
还有,如果一开始被gaussian判定为C3V的话,是不是对于优化过程中的每一步构型,其对称都是C3V?在我的某一个计算中,初始构型和结束构型都是Oh对称(在gaussview中搭建初始分子时通过point group菜单控制了对称性),但我在.log文件中搜索point group关键词时,发现中间这些构型的point group都是C1。不知这正常不。问题有点多,麻烦您了。
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6楼
2011-05-25 11:25:59
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zhficcas
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【答案】应助回帖
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gmy1990(金币+1): 非常感谢你对论坛的贡献,奖励一下! 2011-05-23 08:43:08
vigaryang(金币+2): 2011-05-23 21:48:17
通过内坐标来控制变量, 这个NH3可能还要引入虚原子来精确定义二面角.
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2楼
2011-05-23 06:20:29
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vigaryang
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引用回帖:
Originally posted by
zhficcas
at 2011-05-23 06:20:29:
通过内坐标来控制变量, 这个NH3可能还要引入虚原子来精确定义二面角.
为什么不用symmetry(pg=?)呢?
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3楼
2011-05-23 06:47:46
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小白如水
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关于对称性方面也是我迷惑的
关注一下。
为了消除虚频有种尝试是忽略对称性(nosymm)这是不是以降低计算精度为代价呢?
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4楼
2011-05-23 09:59:46
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