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vigaryang

木虫 (正式写手)

[求助] 关于结构优化中的对称性问题

如果要优化一个像NH3这种明确知道对称性的分子,是不是在优化时需要事先指定优化过程中对称性不变?如果是的话,是通过symmetry(pg=?)实现呢,还是在分子内坐标输入部分设置变量实现?网上查了一下,发现很难见到与symmetry(pg=?)这个命令有关的信息,不知是为什么。难道对于这种分子也不需要指定对称性吗,而任由其自由优化吗。谢谢。
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sangym

木虫 (著名写手)

引用回帖:
Originally posted by vigaryang at 2011-05-25 15:38:22:
那为什么很多时候在计算中会在命令行中特意加入nosymmetry呢?

是这样的,我的理解不管你的构型有没有对称性,你如果不加对称性的话,程序会自己找对称性,如果你的体系没有对称性你直接加nonsymmetry,程序就不用自己找,直接会默认没有对称性,这样节省时间!!!!这是我理解,如果有更好更详细的答案欢迎交流,呵呵!!祝好运
10楼2011-05-25 19:07:54
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zhficcas

银虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
gmy1990(金币+1): 非常感谢你对论坛的贡献,奖励一下! 2011-05-23 08:43:08
vigaryang(金币+2): 2011-05-23 21:48:17
通过内坐标来控制变量, 这个NH3可能还要引入虚原子来精确定义二面角.
2楼2011-05-23 06:20:29
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vigaryang

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by zhficcas at 2011-05-23 06:20:29:
通过内坐标来控制变量, 这个NH3可能还要引入虚原子来精确定义二面角.

为什么不用symmetry(pg=?)呢?
3楼2011-05-23 06:47:46
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小白如水

铁杆木虫 (小有名气)

关于对称性方面也是我迷惑的 关注一下。
为了消除虚频有种尝试是忽略对称性(nosymm)这是不是以降低计算精度为代价呢?
4楼2011-05-23 09:59:46
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