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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 关于DNA marker 的一些问题
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hebeilishw

金虫 (小有名气)

[交流] 关于DNA marker 的一些问题 已有3人参与

各位都知道提取的质粒跑电泳时会有三条带，从下到上一次是超螺旋，线性，开环，而且有一定的差距，而且超螺旋的往往是主要的带，那么咱们平时用的marker是超螺旋的还是线性的，如果是线性的那么用来比较超螺旋质粒的大小还准确吗？
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1楼 2011-05-01 14:28:41
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冼亮淀粉酶

专家顾问 (知名作家)

生物大分子降解酶
★ ★ ★
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amisking(金币+2): 鼓励发帖应助。 2011-05-01 20:02:58
就看你用什么样的Ladder了，有的是螺旋的，比如λDNA有线性也有落选的，但是1kb Ladder就是片段而已，不是螺旋。线性的和螺旋的相比肯定是不准确的。
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流星来时我许了个愿，愿我有吃有喝还有舒服的猪圈。讨厌发帖前不搜索论坛重复发帖和仅把论坛当解决问题工具，久不看论坛一来就提问者，宁弃EPI和VIP也不回帖。
2楼2011-05-01 17:51:49
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xiaoweiwei121

荣誉版主 (文坛精英)

这潭水蓝的深邃

优秀区长优秀区长优秀版主优秀版主
★ ★ ★
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西瓜(金币+2): 牛啊～ 2011-05-02 08:38:58
不准确
但是要提醒一下，提的质粒，未必是超螺旋，线性，开环
虽然这种解释在我们脑子中基本根深蒂固了
现在更倾向于是：超螺旋，开环，复制中间体
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3楼2011-05-02 01:23:58
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hebeilishw

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by xiaoweiwei121 at 2011-05-02 01:23:58:
不准确
但是要提醒一下，提的质粒，未必是超螺旋，线性，开环
虽然这种解释在我们脑子中基本根深蒂固了
现在更倾向于是：超螺旋，开环，复制中间体

新解，谢谢斑竹！
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4楼2011-05-04 14:57:49
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西瓜

荣誉版主 (知名作家)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
Originally posted by xiaoweiwei121 at 2011-05-02 01:23:58:
不准确
但是要提醒一下，提的质粒，未必是超螺旋，线性，开环
虽然这种解释在我们脑子中基本根深蒂固了
现在更倾向于是：超螺旋，开环，复制中间体

那么以现在的观点，线性排在哪里呢？请赐教哈
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5楼2011-05-04 16:41:00
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xiaoweiwei121

荣誉版主 (文坛精英)

这潭水蓝的深邃

优秀区长优秀区长优秀版主优秀版主
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西瓜(金币+3): 厉害~学习了！ 2011-05-05 09:05:04
引用回帖:
Originally posted by 西瓜 at 2011-05-04 16:41:00:
那么以现在的观点，线性排在哪里呢？请赐教哈

看胶浓度吧
0.8的话，在超螺旋和开环之间
你可以找个酶切一下
其实电泳一下就能看出来，单酶切之后的线性条带和碱法提出来的质粒的三条带么有重合的

[ Last edited by xiaoweiwei121 on 2011-5-5 at 04:32 ]
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6楼2011-05-05 00:06:20
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