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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】引物特异性PCR（SSP-PCR）检测SNP，是不是容易出现杂带呀
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yhy322

铁虫 (初入文坛)

[交流] 【求助/交流】引物特异性PCR（SSP-PCR）检测SNP，是不是容易出现杂带呀 已有6人参与

用引物特异性PCR检测单点突变，下游引物一样，上游引物只差一个碱基。分别在两个体系（体系1和体系2）中进行PCR，我觉得结果应该是纯合子只有在体系1或体系2二者之一中有条带，杂合子两个体系都有带，且为同样亮度的。
    但为什么我的结果总会是在一个体系中有清晰条带，另一体系中也有模糊条带。是不是这种方法容易出现这种情况，可不可以认为只要不是同等亮度的都可判断为纯合型？
    请各位大侠指教！非常感谢！
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1楼 2011-04-08 09:36:02
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新虫 (初入文坛)
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1949stone(金币+2): 鼓励 2011-04-08 11:14:42
我和你用的方法是一样的，检测出来的都是杂合子，我都快要崩溃了，不知道是不是方法有问题。
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3楼2011-04-08 10:30:55
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新虫 (初入文坛)
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dhd997: 你可以引用回复，你想让谁回答，他就可以看到了 2011-05-10 08:45:50
是啊，我的问题就是不管是在哪个体系中，P出来的产物条带都很亮，所以就想测序一下，但是不知道测序后如何判断突变位点的基因型是怎样的情况。
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5楼2011-04-08 13:12:15
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新虫 (初入文坛)
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引用回帖:
Originally posted by yj-lzx at 2011-04-08 13:41:06:
这个的话，你的引物设计的要给力啊~~~
我最近用的方法跟楼主的也差不多~~~
不过有的也不好判啊~~~
那些不清楚的不晓得是不是杂带


[ Last edited by yj-l ...

这个问题很难说啊。我咨询过好多人，都觉得那种别太清楚的也算是P出来东西啦
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9楼2011-04-08 19:14:09
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