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xu19850927

银虫 (小有名气)


[交流] 【求助】关于SNP位点

近日,老师让我整理某个基因上已发现的全部SNP位点(通过数据库),包括RS号,在染色体上的位置,在mRNA上的位置,以及序列标注等。请问用哪个数据库最方便,该怎么查找,谢谢
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xiadongliang

金虫 (正式写手)


★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
lstt09nk(金币+2): 感谢推荐,不过好像楼主的问题没有完全解决~ 2011-06-20 13:22:41
2楼2011-04-28 12:33:38
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guoyuan8328

新虫 (初入文坛)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
试了上楼推荐的Ensembl,怎么还是找不到rs?谢谢
3楼2011-06-20 12:14:04
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xiadongliang

金虫 (正式写手)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
Originally posted by guoyuan8328 at 2011-06-20 12:14:04:
试了上楼推荐的Ensembl,怎么还是找不到rs?谢谢

将鼠标移到SNP位点的碱基处,会显示rs号,见图。

4楼2011-06-20 15:59:30
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xhnzpy

新虫 (初入文坛)



小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖
http://snpper.chip.org/ ,网站里列出了对于某个基因已发现的所有SNP位点,并且有相关注释
5楼2011-06-21 16:51:24
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1297286362

铜虫 (初入文坛)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
NCBI数据库比较全
6楼2014-11-04 21:56:27
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