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laverne

铜虫 (小有名气)

[交流] SNP与点突变有何区别？求高人指导

大家好，请高人指导关于SNP的理解
我的疑惑： SNP即单核苷酸多态性，在人及动物的研究中有涉及致病基因。但本人仅限于原核生物研究，所以希望大家对原核生物中的SNP的理解给予帮助。
在原核生物测序已知的情况下如何界定？
是几种近缘生物的统一位点比对得到的么？
这种SNP的信息对于实验方向有没有指导啊？比如根据这些SNP位点，我可以做些什么？
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1楼 2012-09-07 16:00:21
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回帖置顶 ( 共有4个 )

王平阳

金虫 (正式写手)
★ ★ ★ ★
laverne(金币+1): 谢谢参与
小丹木木: 金币+3, 鼓励应助 2012-09-10 15:38:28
单核苷酸多态性即SNP和点突变当然不同，SNP是各种生物都有的，通过同源基因比对得到的，一般不会发生变化，而点突变只对单一基因而言，所以从数量上SNP比点突变多得多，由于SNP的动态性丰富，从而成为了第三代遗产标记，下面是SNP简介：
全称Single Nucleotide Polymorphisms，是指在基因组上单个核苷酸的变异，形成的遗传标记，其数量很多，多态性丰富。从理论上来看每一个SNP 位点都可以有4 种不同的变异形式,但实际上发生的只有两种,即转换和颠换,二者之比为1 :2。SNP 在CG序列上出现最为频繁,而且多是C转换为T ,原因是CG中的C 常为甲基化的,自发地脱氨后即成为胸腺嘧啶。一般而言,SNP 是指变异频率大于1 %的单核苷酸变异。在人类基因组中大概每1000 个碱基就有一个SNP ,人类基因组上的SNP 总量大概是3 ×10E6 个。因此,SNP成为第三代遗传标志,人体许多表型差异、对药物或疾病的易感性等等都可能与SNP有关。
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2楼2012-09-08 09:19:31
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exon2002

铁杆木虫 (著名写手)
★
laverne(金币+1): 谢谢参与
楼上的解释很精辟。能否给出SNP检测手段（或给出参考文献）？
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3楼2012-09-09 08:21:21
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晓子

新虫 (初入文坛)
★
laverne(金币+1): 谢谢参与
引用回帖:
3楼: Originally posted by exon2002 at 2012-09-09 08:21:21
楼上的解释很精辟。能否给出SNP检测手段（或给出参考文献）？

单链构象多态性（SSCP）
    变性梯度凝胶电泳（DGGE）
     变性高效液相色谱分析技术（DHPLC）
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5楼2012-09-09 10:58:05
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laverne

铜虫 (小有名气)
那么，根据细菌基因组分析得到的snp位点，我可以做些什么工作呢？或者说我怎样利用这些已知的snp信息呢？
还请各位不吝赐教！谢谢
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6楼2012-09-10 14:26:40
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普通回帖

gcworm

木虫 (职业作家)
★
laverne(金币+1): 谢谢参与
顶你
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4楼2012-09-09 09:02:34
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lucyyang1989

银虫 (小有名气)
★
laverne(金币+1): 谢谢参与
不只楼主是否已解决上面的问题呢？
我也想问这样的问题，得原核的SNP以后可以做什么分析呢？
请楼主赐教，谢谢谢谢。
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7楼2013-04-26 10:08:26
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moon2929

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
继续同问，怎样研究SNP与肿瘤发生的关系呢？可以从哪些实验开始着手？泪眼汪汪地求助
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8楼2013-10-16 14:47:33
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taccycle

铜虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
5楼: Originally posted by 晓子 at 2012-09-09 10:58:05
单链构象多态性（SSCP）
    变性梯度凝胶电泳（DGGE）
     变性高效液相色谱分析技术（DHPLC）...

补充一下，检测SNP的常用技术还有测序、SNaPshot、MLDR、质谱等，这些技术更常用
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9楼2013-10-16 16:06:43
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