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[交流]
【求助】用Gromacs模拟小分子药物及一定辅料在水溶液中的形态该，该如何开始？
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| 请问各位大侠们，如题，本人对小分子药物的模拟一直困扰已久，蛋白质的模拟似乎比较方便，只需要从网站上下载pdb结构文件就可以了，可是药物分子没有对应的pdb文件，因此，要想模拟这些分子的形态，是否需要手动编写药物分子的pdb文件？或者还有其它思路？如果需要手动编写，请问该用何种软件，最好是免费的？ |
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4楼2011-04-02 13:19:10
2楼2011-04-02 13:15:56
3楼2011-04-02 13:19:03
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zh1987hs(金币+2): 谢谢 2011-04-04 22:43:05
Youngchsh(金币+5): 非常感谢 2011-04-05 17:40:47
zh1987hs(金币+2): 谢谢 2011-04-04 22:43:05
Youngchsh(金币+5): 非常感谢 2011-04-05 17:40:47
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需要，楼主可以参考一下论文《天然产物分离的分子动力学模拟研究》，不知道有用没有。 http://cdmd.cnki.com.cn/Article/CDMD-10010-2009260494.htm |
6楼2011-04-02 18:46:20
简单回复
2011-04-02 13:28
回复
Youngchsh(金币+2): 还是感谢一下 2011-04-05 17:40:33
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