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【求助/交流】系统进化树的构建
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marine7388
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[交流]
【求助/交流】系统进化树的构建
各位好:
今天构建了系统进化树,发现有的数值小于50,进一步进行种属鉴定划分为发现同一门的一些种类,竟然与别的门的相似性比门内要高,同一门的种类分布在进化树的不同位置,为毛出现这种情况咧。求解。。谢谢。。
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1楼
2011-03-31 22:33:23
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marine7388(金币+1): 选择性的去掉一些比对菌的依据是?有的数值已经接近于个位数,所以很头大。 2011-04-02 08:11:59
帮你顶
你可以选择性的去掉些比对菌再建树
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2楼
2011-04-01 20:06:31
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xp198766
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marine7388(金币+1): 16S片段。。呵呵。 2011-04-02 08:12:16
你用的什么基因?
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3楼
2011-04-01 21:51:53
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zmw_520
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marine7388(金币+1): 一起加油吧。。 2011-04-02 08:12:29
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4楼
2011-04-01 23:47:19
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mirror3895
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怎么样的树算做好呢
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5楼
2011-04-02 08:15:01
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sdkdzengya
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需要继续学习
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6楼
2011-04-02 10:06:09
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xp198766
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dhd997(金币+3): good 2011-04-03 08:40:40
如果你建树过程没有问题的话,有可能那些被分成不同的门的是用形态学方法分出来的,分子方法有差异可以继续用别的基因做下试试
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7楼
2011-04-02 12:55:15
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Originally posted by
xp198766
at 2011-04-02 12:55:15:
如果你建树过程没有问题的话,有可能那些被分成不同的门的是用形态学方法分出来的,分子方法有差异可以继续用别的基因做下试试
这么说有可能要果敢的推翻一个门?
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8楼
2011-04-15 20:41:35
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xp198766
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西瓜(金币+2): 鼓励 2011-04-16 00:02:07
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Originally posted by
秋电工
at 2011-04-15 20:41:35:
这么说有可能要果敢的推翻一个门?
如果是一个门的话,一般是不会出现你这种情况的,那要再看看你的建树过程有没有出错了。。。
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9楼
2011-04-15 23:16:52
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+0.5
):给个红包,谢谢回帖
1949stone(金币+4): 恐怕指细菌的多些 2011-04-24 14:24:15
你针对某个基因所建的进化树,不能反应这个物种与其它物种的亲缘关系。因为这些基因在进化上的保守程度不应定能反应他们的亲缘关系。一般是用核糖体16S序列来做物种亲缘关系的进化树的。 针对某个基因的只能说这个基因在进化上的保守程度
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10楼
2011-04-24 14:21:43
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这个情况是正常的~
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11楼
2011-04-24 16:21:27
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beibei9535
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西瓜(金币+4): 鼓励!近期在本版很活跃哦,考虑下跳槽吧,哇哈哈哈~ 2011-04-24 16:24:32
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Originally posted by
zmw_520
at 2011-04-01 23:47:19:
我的进化树也做得不好,求高手支招......
去学一下吧。
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3073595
这个讲的挺好的~
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12楼
2011-04-24 16:22:12
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beibei9535
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小木虫(金币
+0.5
):给个红包,谢谢回帖
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Originally posted by
mirror3895
at 2011-04-02 08:15:01:
怎么样的树算做好呢
去学习下吧、
http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=3073595
呵呵
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13楼
2011-04-24 16:23:13
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