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txzhuwenxiu6285

新虫 (初入文坛)


[交流] 【求助/交流】求PCR二次扩增引物

我做的是厌氧反应器中微生物群落的变化,现在已经做好DGGE了,下面就是胶回收后在PCR,然后测序。我第一次PCR时用的引物是341FGC和534R,想二次扩增时用引物GC2-341和534R,以及测序之前用引物GC1-S和534R,请问哪位高手能告诉我GC2-341和GC1-S的引物序列,我想让上海生工帮我合成,万分感谢!!!急!!!!
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tingspdf

至尊木虫 (著名写手)



txzhuwenxiu6285(金币+1):谢谢参与
txzhuwenxiu6285(金币+1): 2011-03-29 22:39:10
帮楼主顶起,顺便问问楼主用什么方法回收的DGGE片段?
2楼2011-03-29 17:24:32
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txzhuwenxiu6285

新虫 (初入文坛)


Sample Text
我买的是专门的回收试剂盒回收的,下步就不知道这个引物具体什么设计了,你能帮帮我吗
3楼2011-03-29 22:38:37
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tingspdf

至尊木虫 (著名写手)


引用回帖:
Originally posted by txzhuwenxiu6285 at 2011-03-29 22:38:37:
Sample Text
我买的是专门的回收试剂盒回收的,下步就不知道这个引物具体什么设计了,你能帮帮我吗

这两个引物名称你是从哪查的?
4楼2011-03-30 09:04:16
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nienie2008

金虫 (小有名气)



txzhuwenxiu6285(金币+1):谢谢参与
我也想做类似的实验,楼主能写明回收试剂盒的具体名称吗?我上网查了,大部分试剂盒都是针对琼脂糖凝胶的。另外,不知楼主从哪查的这些引物,用PCR引物测序不行吗?
5楼2011-03-30 15:38:06
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txzhuwenxiu6285

新虫 (初入文坛)


引用回帖:
Originally posted by tingspdf at 2011-03-30 09:04:16:
这两个引物名称你是从哪查的?

我们这有个老师在日本呆了好几年  她一直是做DGGE的  她当时也是做的厌氧反应器中的微生物菌群,她建议我查这两个引物的。
6楼2011-03-31 22:54:01
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txzhuwenxiu6285

新虫 (初入文坛)


★ ★ ★
dhd997(金币+3): 热心。 2011-04-01 08:43:41
引用回帖:
Originally posted by nienie2008 at 2011-03-30 15:38:06:
我也想做类似的实验,楼主能写明回收试剂盒的具体名称吗?我上网查了,大部分试剂盒都是针对琼脂糖凝胶的。另外,不知楼主从哪查的这些引物,用PCR引物测序不行吗?

上海生工的UNIQ-10柱式PAGE胶回收试剂盒  你可以到他们公司页面上下载这个试剂盒的PDF说明,看看你能不能用;另外,你是不是研究的具体的哪个微生物,然后PCR产物可以直接测序,而我的是一个反应器中的整个微生物菌群,所以我是做完DGGE后,将优势菌种的条带切下,然后回收,再PCR,最后再测序的,而上面两个引物就是我二次增幅所想要用的引物,但是我一直找不到这个序列,所以纠结,虽然用之前的引物也可以,但可能扩增的特异性不好,那样测序的结果可能不太好。
7楼2011-03-31 22:59:06
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sunbio

禁言 (小有名气)


txzhuwenxiu6285(金币+1):谢谢参与
本帖内容被屏蔽

8楼2011-04-01 10:52:14
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sai00fuji

金虫 (正式写手)



txzhuwenxiu6285(金币+1):谢谢参与
小广告真多啊
9楼2011-04-05 23:06:45
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良缘百合

金虫 (正式写手)



txzhuwenxiu6285(金币+1):谢谢参与
DGGE之前的PCR,引物带夹子是为防止完全解链,DGGE后的PCR引物为什么还要带夹子呢?不知道是什么原理啊
我按“张永生,2010,贝加尔针茅”的那篇的文章扩增了341f和518r,准备DGGE后的PCR用……
10楼2011-05-25 08:23:36
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王冠傑

铁虫 (小有名气)



txzhuwenxiu6285(金币+1): 谢谢参与
直接找生工问不行吗
11楼2015-05-13 08:48:17
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halfbeer

捐助贵宾 (小有名气)



txzhuwenxiu6285(金币+1): 谢谢参与
这广告打的
12楼2015-05-13 10:01:22
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