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xd200620940铜虫 (正式写手)
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[交流]
【求助】如何保持模拟过程中二聚体对称性 已有3人参与
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一个蛋白可以对称性同源二聚，也可以非对称性异源二聚 工作方案已定，但在进行时，发现有个问题未考虑：动力学过程中蛋白同源二聚体对称性是否保持？ 一般性推定：动力学过程中各单体对应原子运动相同，因此二聚体的对称性在动力学过程中应该是保持的 但，动力学结果表明：同源二聚体对称性在动力学过程中发生改变，很是纠结....... 请教达人： 1. 二聚体对称性在动力学过程中是否改变？若变化，是二聚体的本身结构动力学特征，还是模拟参数设置存在问题？ 2. 是否需要设置对称性保持模拟参数？若需要，如何设置？ [ Last edited by xd200620940 on 2011-3-26 at 22:05 ] |
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