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xd200620940铜虫 (正式写手)
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[交流]
【求助】如何保持模拟过程中二聚体对称性 已有3人参与
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一个蛋白可以对称性同源二聚,也可以非对称性异源二聚 工作方案已定,但在进行时,发现有个问题未考虑:动力学过程中蛋白同源二聚体对称性是否保持? 一般性推定:动力学过程中各单体对应原子运动相同,因此二聚体的对称性在动力学过程中应该是保持的 但,动力学结果表明:同源二聚体对称性在动力学过程中发生改变,很是纠结....... 请教达人: 1. 二聚体对称性在动力学过程中是否改变?若变化,是二聚体的本身结构动力学特征,还是模拟参数设置存在问题? 2. 是否需要设置对称性保持模拟参数?若需要,如何设置? [ Last edited by xd200620940 on 2011-3-26 at 22:05 ] |
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4楼2011-04-12 21:31:49
wally8962
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2楼2011-03-28 12:04:43
xd200620940
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3楼2011-03-29 01:30:52













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