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xnbioinfor

铜虫 (小有名气)


[交流] 【求助/交流】质粒浓度达到多少 测序没有问题

提取质粒送去测序 ,测序之前想测一下质粒浓度,浓度多大 测序没问题呢
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gongeleven

铁杆木虫 (正式写手)


10ng/ul以上肯定可以吧
2楼2011-03-20 23:12:00
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zhangxn2010

木虫 (著名写手)


只要质量好,一般试剂盒小提的都不错
3楼2011-03-20 23:48:37
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翱宇

禁虫 (正式写手)


多给一些吧,这洗脱时多加点洗脱液,就好了,不知为何不送菌种呢,好像送质粒必须以ddH2O溶解!
4楼2011-03-20 23:50:50
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送质粒,告诉公司浓度很低,让他们自己转化了,再提质粒,LZ自己就等着测序结果就好了
5楼2011-03-21 09:03:47
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zhangby2002

银虫 (小有名气)


引用回帖:
Originally posted by xnbioinfor at 2011-03-20 22:45:05:
提取质粒送去测序 ,测序之前想测一下质粒浓度,浓度多大 测序没问题呢

我菌液也送过。质粒也送过,质粒用碱裂解发粗提取,质粒都达到1000多,至2000-3000ng,也有几百ng,但是测序还有套峰,效果不好。也比较纠结!
6楼2011-03-21 14:54:47
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zhangby2002

银虫 (小有名气)


引用回帖:
Originally posted by roomofxw at 2011-03-21 09:03:47:
送质粒,告诉公司浓度很低,让他们自己转化了,再提质粒,LZ自己就等着测序结果就好了

请教一下,你测序结果很好吗、?你质粒提取,用的试剂盒or碱裂解发粗提取?核算定量多少ng??
7楼2011-03-21 14:57:13
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walker2898

银虫 (小有名气)


直接送菌液就行了,让他们提质粒测序就可以了。
8楼2011-03-21 15:02:08
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引用回帖:
Originally posted by zhangby2002 at 2011-03-21 14:57:13:
请教一下,你测序结果很好吗、?你质粒提取,用的试剂盒or碱裂解发粗提取?核算定量多少ng??

测序结果挺好的啊
试剂盒提过 自己配试剂也提过 都还可以啊
我是pET拷贝很低,浓度不怎么样,有时候胶上勉强看得见,但是测序没什么问题
9楼2011-03-21 15:37:42
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orangeleaf

铜虫 (正式写手)


送菌液吧
10楼2011-03-21 18:38:39
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csdyg

木虫 (正式写手)


一般sanger法测序,质粒300ng足够一次测序,为了保证测序质量,一般在600-700ng之间为宜

样品浓度过大,如果不向测序公司说明,会影响测序效果,严重时可能有损测序仪

[ Last edited by csdyg on 2011-3-22 at 06:20 ]
11楼2011-03-22 06:19:10
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