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【求助】键长键角等固定后的优化..悬赏30...【已经解决～感谢～】
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新手问题........... 现在正在找一个过渡态，没有固定键长键角之前，构型偏离较大最后就不能收敛，或者分子散了，若构型偏离较小就会优化直接到稳定态 现在准备固定某个键长后继续优化，用gaussview建立模型之后，用自带的redundant，然后手动再修改某几个数值，输入文件中有： D 4 1 2 3 -120.000000 F 这样的描述，计算过程中也没有出错，但是最后键角仍旧偏离较大，键长也是如此 想请教一下这个如果固定键长之后优化，gaussian是在这个输入结构附近寻找收敛点么？若在这个点附近找不到最小点是不是就会破坏这个限制？加上了键长键角限制之后和没有加键长键角有什么区别呢？ 或者....悲情的就是固定方法不对，输入文件不对？ 求大神详解...或者能麻烦提供详解的链接地址么？.... [ Last edited by 亍寞 on 2011-3-12 at 21:17 ] |
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 量化计算有意义的讨论 | Gaussian |
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2楼2011-03-12 14:31:06
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谢谢，现在您所说的主要的反应坐标已经找到了，是键长，但是就是再固定的时候除了点问题，固定之后计算，但是计算结果中这个希望固定的键长你却恢复了稳定态的键长，因为以前没有固定过键长进行计算，所以也不知道是不是固定方法有问题 这是部分输入文件：（z-matrix） %mem=3500MB %nprocshared=2 #p opt=(modredundant,maxcyc=200) freq b3lyp/genecp scf=tight 键说明部分。。。略 B1 4.900000 基组说明部分。。。略 请问这个是一定要用popt命令么？那么popt（参数）中的参数又应该怎么设置比较好？您所说的反应坐标的逐渐改变是用scan命令还是人为的固定不同键长? 十分感谢您的回复！ |
3楼2011-03-12 15:04:00
4楼2011-03-12 16:55:50
5楼2011-03-12 17:22:28
6楼2011-03-12 18:42:32
7楼2011-03-12 19:06:50
8楼2011-03-12 19:23:36
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谢谢回复，这个原理我明白，是输入文件的问题，麻烦您看下，这是我刚才用乙烷分子做了尝试，想固定两个碳原子之间的距离之后优化，这是输入文件 %mem=3200MB %nprocshared=2 #p opt(modredundant) freq b3lyp/6-31g scf=tight Title Card Required 0 1 C H 1 B1 H 1 B2 2 A1 H 1 B3 2 A2 3 D1 C 1 B4 2 A3 3 D2 H 5 B5 1 A4 2 D3 H 5 B6 1 A5 2 D4 H 5 B7 1 A6 2 D5 B1 1.07000000 B2 1.07000000 B3 1.07000000 B4 2.00000000 B5 1.07000000 B6 1.07000000 B7 1.07000000 A1 109.47120255 A2 109.47123134 A3 109.47120255 A4 109.47120255 A5 109.47120255 A6 109.47123134 D1 119.99999260 D2 -120.00001480 D3 179.88890000 D4 -60.11108520 D5 59.88890740 constant: B 4 5 2.00000000 （4 5 原子就是两个碳原子） 计算过程中没有出错，但是在最后看输出文件的时候发现键长又回去了，不知道应该怎么输入，像上面那个输入文件，应该怎么改可以改对呢？ |
9楼2011-03-12 19:32:20
11楼2011-03-12 19:55:18
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乙烷你可以试试这个： #p opt(modredundant) b3lyp/6-31g scf=tight Title Card Required 0 1 C 0.000000 0.000000 0.000000 C 0.000000 0.000000 1.450000 H 1.026719 0.000000 1.813000 H -0.513360 0.889165 1.813000 H -0.513360 -0.889165 1.813000 H -1.026719 0.000000 -0.363000 H 0.513360 0.889165 -0.363000 H 0.513360 -0.889165 -0.363000 B 1 2 2.0 F 空行 |
12楼2011-03-12 20:05:17
13楼2011-03-12 20:41:41
14楼2011-03-12 21:09:27
15楼2011-03-12 21:15:30
16楼2011-03-12 22:13:37
17楼2011-03-12 23:33:54
18楼2011-03-13 08:15:28
19楼2012-03-05 11:23:28
20楼2012-03-30 11:51:03
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angelkiss10楼
2011-03-12 19:38
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zq52252621楼
2012-03-30 17:49
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蓝色调调22楼
2012-03-30 17:51
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亍寞(金币+1): 谢谢参与