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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 材料区 » 晶体 » 基础理论 » 【请教】关于生成键长键角问题的求助
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yadff

新虫 (初入文坛)

[交流] 【请教】关于生成键长键角问题的求助已有4人参与

我的晶体结构中有2种Cu。Cu1和6个N配位，Cu2和4个N还有2个水分子配位。可是在shexlt里生成键长时Cu1却只有4个，分别是Cu1-N1（2.035),Cu1-N3（2.047),Cu1-N4（2.092),Cu1-N6（1. 983),剩下的那2个却没有，我在diamond里手动的量了一下剩下的那2个Cu1-N2（2.681)，Cu1-N5（2.583).但是diamond里的distance\angles里也没有这2个键长。Cu2情况类似，我该怎么办。我写文章时怎么解释这一现象呢？希望大家帮帮我，我将万分感谢。
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1楼2010-07-06 20:36:49
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cluster8676

至尊木虫 (著名写手)
★
yadff(金币+5): 2010-07-07 08:06:13
yunruirui(金币+1):谢谢交流，希望常来 2010-07-08 09:56:30
你在解结构的时候有没有看到这些键呢？如果没有，你要在INS文件里加入BIND Cu N1 命令，让这两个原子键连。如果还不行你就试试LINE命令~希望有帮助
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学无止境
2楼2010-07-06 22:56:07
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yadff

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
Originally posted by cluster8676 at 2010-07-06 22:56:07:
你在解结构的时候有没有看到这些键呢？如果没有，你要在INS文件里加入BIND Cu N1 命令，让这两个原子键连。如果还不行你就试试LINE命令~希望有帮助

就是我在cif文件里看的时候这几个键都是连在一起的，Cu1是和六个N相连的。可是生成键长的时候就没有生成最长的那2个键了。
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3楼2010-07-07 08:08:27
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cluster8676

至尊木虫 (著名写手)
yunruirui:谢谢交流，希望常来 2010-07-08 09:57:11
引用回帖:
Originally posted by yadff at 2010-07-07 08:08:27:

就是我在cif文件里看的时候这几个键都是连在一起的，Cu1是和六个N相连的。可是生成键长的时候就没有生成最长的那2个键了。

你把修完的文件给我发过来看看吧！
zhangqiang1208@gmail.com
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学无止境
4楼2010-07-07 22:54:16
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yunruirui

荣誉版主 (著名写手)

云朵爸
★
yanhualover(金币+1):谢谢交流 2010-07-08 12:01:12
yadff(金币+10): 2010-07-10 14:06:12
在显示原子是否成键，各个软件是不同的，因为他们的默认成键距离不一样，你可以更改他们的默认值，这样就可以使各个仪器相同了。
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5楼2010-07-08 09:58:25
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yeqs1

铁杆木虫 (职业作家)
★
yanhualover(金币+1):谢谢交流 2010-07-08 12:01:17
yadff(金币+10): 2010-07-10 14:06:55
这个是因为这两个键长太长了，超出了程序的设定范围，
程序默认这两个没有成键，
一般来说铜都是形成严重变形的八面体配位形式，
轴向的两个键长特别长，
这时要手动将它们设置成键！
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6楼2010-07-08 10:36:33
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yadff

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
Originally posted by yeqs1 at 2010-07-08 10:36:33:
这个是因为这两个键长太长了，超出了程序的设定范围，
程序默认这两个没有成键，
一般来说铜都是形成严重变形的八面体配位形式，
轴向的两个键长特别长，
这时要手动将它们设置成键！

不好意思，怎么在diamond里面手动设置使之生成键长和键角啊?
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7楼2010-07-10 14:12:21
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yeqs1

铁杆木虫 (职业作家)
★
yanhualover(金币+1):谢谢交流 2010-07-11 23:10:22
yadff(金币+10): 2010-07-12 08:13:02
在diamond里面可以通过设置“build-----connectivity”它们成键，但好像在键长表中也没有这个值。
但问题好像不大，我发文章的时候都没管CIF文件里有没有这些
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8楼2010-07-11 21:07:23
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yadff

新虫 (初入文坛)
引用回帖:
Originally posted by yeqs1 at 2010-07-11 21:07:23:
在diamond里面可以通过设置“build-----connectivity”它们成键，但好像在键长表中也没有这个值。
但问题好像不大，我发文章的时候都没管CIF文件里有没有这些

我在描写晶体结构的时候需要列举金属铜的配位的键长和键角，就是觉得这2个很大，和其余的4个不一样。我还需要把这2个不同的列举出来吗？谢谢了
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9楼2010-07-12 08:11:50
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yeqs1

铁杆木虫 (职业作家)
yadff(金币+15):谢谢了。 2010-07-13 09:52:12
一般在写文章时都要提到这两个比较特别的键长的，
你可以多看看相关文献，看别人是怎么写的
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10楼2010-07-12 09:08:21
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