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亍寞

金虫 (小有名气)


[交流] 【求助】键长键角等固定后的优化..悬赏30...【已经解决~感谢~】

新手问题...........
现在正在找一个过渡态,没有固定键长键角之前,构型偏离较大最后就不能收敛,或者分子散了,若构型偏离较小就会优化直接到稳定态
现在准备固定某个键长后继续优化,用gaussview建立模型之后,用自带的redundant,然后手动再修改某几个数值,输入文件中有:
D 4 1 2 3 -120.000000 F
这样的描述,计算过程中也没有出错,但是最后键角仍旧偏离较大,键长也是如此

想请教一下这个如果固定键长之后优化,gaussian是在这个输入结构附近寻找收敛点么?若在这个点附近找不到最小点是不是就会破坏这个限制?加上了键长键角限制之后和没有加键长键角有什么区别呢?


或者....悲情的就是固定方法不对,输入文件不对?

求大神详解...或者能麻烦提供详解的链接地址么?....

[ Last edited by 亍寞 on 2011-3-12 at 21:17 ]
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qlihytc

新虫 (小有名气)


不是SCAN,这样,给你篇文献看看吧
羟基负离子与一氟甲烷双分子亲核取代反应的量子化学研究
4楼2011-03-12 16:55:50
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qlihytc

新虫 (小有名气)


亍寞(金币+10): 谢谢回复,还有些许问题还请您不吝赐教! 2011-03-12 15:04:29
我建议这样寻找:
找到一个主要的反应坐标,键长或者键角,固定这个反应坐标,然后popt,通过反应坐标的逐渐改变,得到一条反应的PES,再在最高点进行激发态优化
2楼2011-03-12 14:31:06
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亍寞

金虫 (小有名气)


引用回帖:
Originally posted by qlihytc at 2011-03-12 14:31:06:
我建议这样寻找:
找到一个主要的反应坐标,键长或者键角,固定这个反应坐标,然后popt,通过反应坐标的逐渐改变,得到一条反应的PES,再在最高点进行激发态优化

谢谢,现在您所说的主要的反应坐标已经找到了,是键长,但是就是再固定的时候除了点问题,固定之后计算,但是计算结果中这个希望固定的键长你却恢复了稳定态的键长,因为以前没有固定过键长进行计算,所以也不知道是不是固定方法有问题
这是部分输入文件:(z-matrix)
%mem=3500MB

%nprocshared=2

#p opt=(modredundant,maxcyc=200) freq b3lyp/genecp scf=tight
键说明部分。。。略
B1 4.900000

基组说明部分。。。略

请问这个是一定要用popt命令么?那么popt(参数)中的参数又应该怎么设置比较好?您所说的反应坐标的逐渐改变是用scan命令还是人为的固定不同键长?

十分感谢您的回复!
3楼2011-03-12 15:04:00
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亍寞

金虫 (小有名气)


引用回帖:
Originally posted by qlihytc at 2011-03-12 16:55:50:
不是SCAN,这样,给你篇文献看看吧
羟基负离子与一氟甲烷双分子亲核取代反应的量子化学研究

谢谢你,理论部分已经是有一定了解的,主要问题就在如何输入上面,我之前没有用过popt这个命令,不知道相关参数应该怎么改?
这个输入无论用哪一钟坐标形式都没有办法解决,在郭勇和官方指南,还有自带的text中都没有找到相关说明,您有没有类似的资料呢?

不胜感激
5楼2011-03-12 17:22:28
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