| 查看: 3426 | 回复: 16 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[交流]
【讨论】分子模拟还是同源建模
|
|||
| 在做分子对接时，如果没有蛋白质的三维结构，一般通过同源建模得到所需蛋白质的三维结构。现在想和各位虫虫们讨论一下：是在swiss-model上面下载上面自动建模得到的蛋白质好呢，还是自己同源建模得到的三维结构比较好？请各位各抒己见，好让我们这些比较晚接触这方面的有所取舍。 |
回复此楼» 猜你喜欢
一志愿武理材料305分求调剂
已经有5人回复
-
材料专硕英一数二306
已经有3人回复
-
085600材料与化工调剂 324分
已经有7人回复
-
311求调剂
已经有3人回复
-
26调剂/材料/英一数二/总分289/已过A区线
已经有7人回复
-
295求调剂
已经有5人回复
-
354求调剂
已经有5人回复
-
材料专业求调剂
已经有3人回复
-
求材料调剂
已经有7人回复
-
一志愿天大材料与化工（085600）总分338
已经有3人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 求助，已有PDB结构的DS同源建模步骤，谢谢
已经有11人回复
- 求助：本人新手，想分段同源建模，不知道用什么软件和方法？
已经有11人回复
- 蛋白分子建模 小分子化合物画图 酶与配体的分子模拟
已经有11人回复
- surflex-dock对接问题
已经有3人回复
- 分子模拟时间越长越好吗？
已经有44人回复
- swiss model上怎么做二聚体的同源建模
已经有5人回复
- 【求助】在swiss model 同源建模以后得到的结果怎么分析
已经有8人回复
- 【求助】从同源建模开始，一个完整的分子对接实验需要多久？
已经有7人回复
- 【求助】modeller同源建模结果选择
已经有10人回复
- 【讨论】同源建模之后的能量最小化
已经有9人回复
- 【求助】同源建模、分子动力学模拟和分子对接的关系是怎样的
已经有9人回复
- 【讨论】同源建模后酶的辅因子怎么处理
已经有6人回复
- 【原创】分子对接，同源模建，分子动力学软件介绍帖
已经有35人回复
- 【求助】蛋白质建模没有同源模板怎么解决？
已经有11人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
青岛高校2026招生硕士研究生
+5/850
-
2026年国基求好运！
+5/470
-
山东征女友，坐标济南
+1/167
-
电力全国重点实验室双一流A类长江学者团队招2026年全日制博士1名（4月3日截止）
+2/104
-
济南大学林秀娟教授招收材料类博士生
+1/90
-
温州大学吕晶晶课题组2026年招生
+1/80
-
福建师范大学招收2026年化学、材料硕士3-4名
+1/78
-
【代人发帖勿站内信】【成都征男友】89年未婚博士漂亮女孩
+1/70
-
青岛高校 研究生招生
+1/56
-
山东师范大学有机化学专业胡忠燕老师课题组招收2026届硕士研究生以及调剂生
+1/40
-
催化方向推荐一个极好的博导
+1/36
-
澳大利亚西澳大学（UWA）张金强课题组招收全奖博士生（化工新能源方向）
+1/32
-
欢迎生物与医药、药学、化学等相关专业的同学
+1/11
-
课题组招收环境及相关专业调剂硕士研究生（欢迎优秀学生加入）
+1/6
-
北京石油化工学院 张慧杰老师团招2026年研究生复试调剂考生，欢迎联系
+1/4
-
课题组招收环境及相关专业调剂硕士研究生（欢迎优秀学生加入）
+1/2
-
首次招收资格，招收工科调剂！
+1/2
-
福建师范大学环境微生物技术课题组接受2026级硕士调剂
+1/2
-
中国科学院地球化学研究所招科研助理
+1/1
-
西安交通大学生命学院智能化诊疗装备研究中心2026年博士生招生
+1/1
9楼2011-07-02 15:51:45
2楼2011-03-07 12:02:25
3楼2011-06-04 10:49:39
★
奋斗1s(金币+1):谢谢参与
奋斗1s(金币+3): 谢谢你的详细指导呀！ 2011-06-04 18:25:46
奋斗1s(金币+1):谢谢参与
奋斗1s(金币+3): 谢谢你的详细指导呀！ 2011-06-04 18:25:46
|
其实这个标题取得就有问题，呵呵~同源模建只是分子模拟的一种手段而已，自己建模是个什么意思？我的理解是利用modeller?这里有几个问题需要说明： 1.其实modeller和SWISS-MODEL构建模型的过程是很类似的，如果目标蛋白和模板蛋白的序列一致性比较高的话，SWISS-MODEL是个很不错的选择啊！ 2.对于序列一致性比较低的序列来说，两种软件都不会是最好的选择，这是同源模建本身的方法引起的，而不是软件之间的不同。 3.如果你有比较奇怪的要求的话，modeller可以自己控制的步骤比较多，相对来说自由度能大一些，但是现在SWISS-MODEL也可以实现杂原子建模和多聚体建模了~我感觉就很不错了 4.SWISS-MODEL本身提供了一些模型评价的指标，对你了解模型的质量有很大的帮助，为何不用呢？哈哈 |
4楼2011-06-04 11:08:36
