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[交流]
【求助/交流】DNA提取方法（用于PCR-DGGE）
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我是环境专业的，课题做到这里导师要我用PCR-DGGE生物技术来做菌群分析。 我的反应器是陶粒反应器，具体的就是在陶粒上负载吸附了能处理特定污染物的菌体,导师让我每个实验阶段都取样去做优势菌群分析。 请问各位大虾我这个情况，要提取菌的DNA要用怎样的方法？还有陶粒上的微生物怎样才能全部洗脱下来做菌群分析？ 在生物方面我只知道皮毛，劳请各位生物方面做过这方面研究的同仁们了！ |
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rainwander(金币+3): 鼓励积极参与交流~~~ 2011-02-27 16:40:59
vanewan(金币+2): 2011-02-27 16:52:06
rainwander(金币+3): 鼓励积极参与交流~~~ 2011-02-27 16:40:59
vanewan(金币+2): 2011-02-27 16:52:06
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DGGE就是聚丙烯酰胺凝胶电泳的简称嘛。我没有听说过还有“变性琼脂糖凝胶”这个种DGGE胶。。  DGGE方法有其限制，所使用的PCR产物，带GC夹，长度只有小于500bp的PCR产物才能得到最后的分离。所以这么短的PCR产物所包含的序列信息是有限的。很多不同条带测序后的结果竟然是同一物种。。  如果你做细菌的话，可以用下比较长的引物做DGGE，比如引物341F和907R，这个扩增产物较长，但有时DGGE不怎么好看，因为PCR产物分离的不彻底，太长了。 如果想得到很好看的细菌图谱，就用338F和518R吧，这个只有180bp的PCR片段在DGGE的时候会得到最彻底的分离。 |
7楼2011-02-27 13:43:45
2楼2011-02-24 18:46:41
3楼2011-02-25 10:05:45
4楼2011-02-25 22:14:42
