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wzbhit

至尊木虫 (著名写手)

应助: 84 (初中生)
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[交流] 【求助】MS如何实现水分子与SiO2反应的分子动力学模拟过程（想得到Si-OH键）？

1、MS Discover或Forcite模块（其它模块也可以）如何实现水分子（H2O）与SiO2反应的分子动力学过程（想得到Si-OH键）？如何放置水分子到SiO2表面？
参考MS tutorial，直接把水分子粘贴放置到SiO2表面，但是Discover Dynamic后观察轨迹文件，没有任何水分子要与SiO2反应的迹象，没有形成Si-OH。
2、MS中如何实现将两片SiO2放置到一起？已使用方法：使用MS Build —> Build layer来将第一层放SiO2、第二层也放SiO2。但是用Discover模拟，查看轨迹文件没有任何形成Si-O-Si键的过程。
3、MS中把晶体形态的SiO2高温退火后得到的是否是非晶态的SiO2？如何实现高温退火处理，用的Forcite anneal是否可以做到？
以上三个问题困扰小弟很久了，希望前辈们指点，十分感谢！

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1楼2011-02-24 09:34:20

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wangth08

金虫 (正式写手)

应助: 10 (幼儿园)
金币: 2676.7
帖子: 449
在线: 110.8小时
虫号: 844864

★ ★
wzbhit(金币+2):谢谢参与
zzy870720z(金币+1): 谢谢交流 2011-03-01 22:37:18

用第一原理分子动力学算算吧，要是系统小的话，经典分子动力学应该对分子间相互作用力比较合适的饿

赞一下(2人)

9楼2011-03-01 22:21:03

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