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wzbhit

至尊木虫 (著名写手)

应助: 84 (初中生)
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帖子: 1162
在线: 256.7小时
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[交流] 【求助】MS如何实现水分子与SiO2反应的分子动力学模拟过程（想得到Si-OH键）？

1、MS Discover或Forcite模块（其它模块也可以）如何实现水分子（H2O）与SiO2反应的分子动力学过程（想得到Si-OH键）？如何放置水分子到SiO2表面？
参考MS tutorial，直接把水分子粘贴放置到SiO2表面，但是Discover Dynamic后观察轨迹文件，没有任何水分子要与SiO2反应的迹象，没有形成Si-OH。
2、MS中如何实现将两片SiO2放置到一起？已使用方法：使用MS Build —> Build layer来将第一层放SiO2、第二层也放SiO2。但是用Discover模拟，查看轨迹文件没有任何形成Si-O-Si键的过程。
3、MS中把晶体形态的SiO2高温退火后得到的是否是非晶态的SiO2？如何实现高温退火处理，用的Forcite anneal是否可以做到？
以上三个问题困扰小弟很久了，希望前辈们指点，十分感谢！

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1楼2011-02-24 09:34:20

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youjie-888

银虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
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帖子: 53
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虫号: 1219823

★ ★
wzbhit(金币+2):谢谢参与
zzy870720z(金币+1): 鼓励讨论 2011-03-28 17:19:13

我个人认为你的模型有问题：为什么不把SiO2放在一层，弄两层什么意思。一层的话成键应该没有问题，另外，与水接触的表面是不是需要处理，否则是不是不反应，我个人的观点，是否有帮助，不得而知。

赞一下(2人)

10楼2011-03-28 15:25:39

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