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[交流]
【求助/交流】请教小麦HSP70的一段序列
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| 我做过HSP70蛋白的western表达，有趋势。所以想继续从RNA水平做RT试试。但是没有找到小麦HSP70的序列，无法设计引物，有高人知道么，希望不吝赐教，感恩不尽。嘿嘿 |
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amisking(金币+2): 鼓励发帖交流！ 2011-01-16 18:45:12
Arisna(金币+1): 2011-01-16 20:08:43
Arisna(金币+14): 2011-01-16 20:09:05
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Arisna(金币+1): 2011-01-16 20:08:43
Arisna(金币+14): 2011-01-16 20:09:05
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从NCBI上找就行，我帮你看了一下是不是这个http://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/542817 http://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/6996622 |
2楼2011-01-16 14:44:39
3楼2011-01-16 20:11:53
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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lstt09nk(金币+2): 辛苦~~ 2011-03-15 12:36:53
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lstt09nk(金币+2): 辛苦~~ 2011-03-15 12:36:53
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hsp70不是一个成员，应该有多个基因。你看看这两个 AK332587.1| Triticum aestivum cDNA 145-2199 1 gaaggcctct cgccatttct cccttctctc aatcgcccaa aacccacgcg aatccaccag 61 ccccttcctt caacttcctg ccccttgtag ggtttcgccc cccaccaacc cctacccccc 121 gggttactgc tcgtgctctc agccatggcg accacgacct tccccacctc gacccccttc 181 ttcgtccatc acggcacccg gcgcccctcc gtcaacctcc gaacggccgc ggtggtgtac 241 ggccgtggtg ggcggcggtg gcggccactg cgcgtcgcct gcgagaaggt ggtggggatc 301 gacctcggga ccaccaactc agcggtcgcg gcgatggagg gcggcaagcc caccatcgtc 361 accaacgccg agggcgcgcg gaccacgccg tcggtcgtgg cgtacaccaa ggccggggac 421 cggctggtgg gacagatcgc caagaggcag gcggtggtca acccggagaa caccttcttc 481 tcagtcaaga ggttcatcgg ccgaaagatg aacgaggtcg ccgaagagtc caagcaggtt 541 tcctaccgcc ttgtccggga cgataacggc aacgtcaagc tcgattgccc agcaattggc 601 aagcagttcg ccgcggagga gatctctgca caggtcctga gaaagctggt tgatgatgca 661 tcaaagtttt taaatgacaa agtcaccaag gcagtgatca cagttcctgc ttatttcaat 721 gactcccaga ggacggctac aaaagatgcc ggccgcattg caggcctgga tgttctccgt 781 atcataaacg agcctaccgc ggcatcgttg gcatatggtt ttgaaaaaaa gaacaatgaa 841 acaattctgg tttttgacct gggaggaggc acctttgatg tttcagttct cgaagttggt 901 gatggtgttt ttgaggtgct gtctacatct ggtgatactc accttggcgg tgatgacttt 961 gacaagagaa ttgttgattg gctggctggg agcttcaaga atgatgaggg tattgacctg 1021 ctaaaagaca agcaagctct ccagcgtctt acagaagcag ctgagaaggc caagatggaa 1081 ttgtcatcgt tgacccaaac aaatatcagt ttacctttca ttacagctac tgctgatggg 1141 cccaagcata ttgagacaac acttaccagg ggtaaatttg aggagctatg ctcagatctt 1201 cttgacaggc tgaggacacc tgttgacaat tctcttagag atgcgaagtt gtcacttaaa 1261 gaaatagatg aggtgattct tgtgggtggt tccacaagaa ttccagctgt tcaggatctt 1321 gtgaagaaaa tgacgggaaa ggatcccaat gtgacagtca atcccgatga ggttgttgct 1381 cttggagcag cggtgcaggc aggagtattg tcgggcgatg tgagcgatat tgtgcttctt 1441 gatgttacgc cactgtctct tggtttggag acactgggtg ggatgatgac caagattatc 1501 ccaaggaaca caaccctccc tacctccaag tcagaggtct tttcaacggc tgctgatgga 1561 cagactagtg tggagattaa tgttctccaa ggagaaagag agtttgttag ggacaataaa 1621 tcccttggta gcttcaggct tgatggaatt cctcctgctc cgcgtggtgt tccccaaatt 1681 gaagtcaagt ttgatattga tgccaacggc attctgtctg ttgctgcggt ggataagggc 1741 actgggaaga agcaggacat tacgatcact ggagccagca cactgccaaa ggatgaggta 1801 gagaagatgg tggaagaagc tgaaaaattt gcggcggagg acaaggagaa gagggacgca 1861 attgacacca agaaccaggc agagtctgtg atgtaccaga ctgagaaaca actgaaggag 1921 ctcggagaca aggtcccagg cgatgtcaag gagaaggtgg aggggaagct caaggaactc 1981 caggatgccg ttgctggtgg atcgacacag acgataaagg atgcactagc tgcgttgaac 2041 caagaagtga tgcagcttgg tcagtccctc taccagcagc aggggtcggg ccctacccct 2101 ggagctgacg gcgctgctga ctctacaggc ccaggcccat ctgagaagac aggcgatggt 2161 ggtgacgtca tagacgctga ttttaccgac agcaattgaa tagaacagta ggttaggaca 2221 tgatgcaaca agtgagtatg aatttgttcc acaggattgc ctagcagtat acgggtgacc 2281 gttttctttg gattgagacc ttgtttgctg tcagggtgtt ggccgagttt ttgatgttga 2341 ggtttggaga cttcagttat cagtttggat gggatagatt ggcttttgct tgttgggaac 2401 ccgacccctt ggccttgtac ggttatgtat tggatttact aactctctag agaactgggt 2461 catttcctgt ttggagcatg tgccaaaaac tggattgtta ttttggggag cattctactc 2521 ccttcgttta taaatataaa gcccttttag agaaaaaaaa aaaaaaaaac ga Cds 1 ATGGCGACCA CGACCTTCCC CACCTCGACC CCCTTCTTCG TCCATCACGG CACCCGGCGC 61 CCCTCCGTCA ACCTCCGAAC GGCCGCGGTG GTGTACGGCC GTGGTGGGCG GCGGTGGCGG 121 CCACTGCGCG TCGCCTGCGA GAAGGTGGTG GGGATCGACC TCGGGACCAC CAACTCAGCG 181 GTCGCGGCGA TGGAGGGCGG CAAGCCCACC ATCGTCACCA ACGCCGAGGG CGCGCGGACC 241 ACGCCGTCGG TCGTGGCGTA CACCAAGGCC GGGGACCGGC TGGTGGGACA GATCGCCAAG 301 AGGCAGGCGG TGGTCAACCC GGAGAACACC TTCTTCTCAG TCAAGAGGTT CATCGGCCGA 361 AAGATGAACG AGGTCGCCGA AGAGTCCAAG CAGGTTTCCT ACCGCCTTGT CCGGGACGAT 421 AACGGCAACG TCAAGCTCGA TTGCCCAGCA ATTGGCAAGC AGTTCGCCGC GGAGGAGATC 481 TCTGCACAGG TCCTGAGAAA GCTGGTTGAT GATGCATCAA AGTTTTTAAA TGACAAAGTC 541 ACCAAGGCAG TGATCACAGT TCCTGCTTAT TTCAATGACT CCCAGAGGAC GGCTACAAAA 601 GATGCCGGCC GCATTGCAGG CCTGGATGTT CTCCGTATCA TAAACGAGCC TACCGCGGCA 661 TCGTTGGCAT ATGGTTTTGA AAAAAAGAAC AATGAAACAA TTCTGGTTTT TGACCTGGGA 721 GGAGGCACCT TTGATGTTTC AGTTCTCGAA 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FDKKIVDWLASTFKNDEGIDLLKDKQALQRLTEAAEKAKMELSTLTQANISLPFITAT ADGPKHIEATLSRAKFEELCSDLIDRLKTPVNNALKDAKLSVSNLDEVILVGGSTRIP AVQETVRKITGKDPNVTVNPDEVVSLGAAVQGGVLAGDVKDVVLLDVTPLSIGLETLG GVMTKIIPRNTTLPTSKSEVFSTAADGQTSVEINVLQGEREFVRDNKSLGSFRLDGIP PAPRGVPQIEVKFDIDANGILSVAAVDKGTGKKQDITITGASTLPKDEVERMVEEADK FAQEDKEKRDAIDTKNQADSVVYQTEKQLKELGDKVPAPVKEKVDVKLQELKDAIAGG STQSMKTAMEALNQEVMQIGQAMYNQTSAGDAGSTDAETEPGAGSTSSGKGPNDGDVI DADFTDSN" ORIGIN 1 ttcactaggg ttagggttta cgtaacgaac ccgcgccatg gctaccttca cttcccaggt 61 cagcgcgatg gctggcgcct ccccgtcgtg ctctctcttc gtgagccggc ggcggccggc 121 ggtcatgccc ctgcagatgc gggttgctcg tggcgggagg ccgcgcgggt tggcgatgcg 181 ggtgacgtgc gagaaggtgg tgggaatcga cctgggcacc accaactccg ccgtcgcggc 241 gatggagggc ggtaagccga cggtgatcac caacgccgag ggccagcgga cgacgccgtc 301 ggtggtggcg tacaccaagg gaggagaacg gctagtgggc cagattgcca agaggcaggc 361 cgtcgtcaac ccggtgaaca ccttcttctc cgtcaagcgc ttcattggac gcaagatggc 421 tgaggtagat gacgaggcca agcaggtctc gtataacgtt gtgcgcgatg agaacggaaa 481 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ttctagggtt gaggatgtta tttttgtatc tcggctccat gtatctacaa 2221 gctgtttatt cagtatatga aatttggtag cggtaggact caacaacgtt tgctagagtg 2281 atcttgaatc aagtataccc ctctggtaat gcaaagatgc aaaaggattt tggtcgaaac 2341 agtagcatat tccctaaaaa gtaaactagc catgtttagg ttagcaataa acgaagtttc 2401 atggtgtaaa |
4楼2011-03-13 12:43:23
5楼2011-03-13 19:12:29
6楼2011-03-14 19:36:21
7楼2011-03-14 19:42:10
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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
lstt09nk(金币+1): 热心 2011-03-15 12:37:03
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lstt09nk(金币+1): 热心 2011-03-15 12:37:03
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Twelve full- length and two truncated DnaK type heat shock protein 70 (hsp70) genes have been identified in Arabidopsis since the completion of the genome sequencing project. While the biochemical mechanism and structure of hsp70 are highly conserved among organisms, the physiological roles of hsp70s in plants remain largely unknown due to promiscuous substrate specificity and functional redundancy of individual hsp70s. To characterize the roles of hsp70 genes in Arabidopsis, the following objectives were undertaken: 1) a comprehensive RT-PCR and genomic analysis for the hsp70 gene family, 2) transgenic approach to over/underexpress two members of the hsp70 gene family, cytosolic Hsc70-1 and ER luminal BiP-2, and 3) microarray analysis of gene expression during induction of acquired thermotolerance. I isolated two nuclear-encoded, organellar members of the Arabidopsis hsp70 gene family mtHsc70-2 (AF217458) and xii cpHsc70-2 (AF217459). Genomic analysis revealed several unique characteristics of the subfamily of Arabidopsis hsp70 gene family such as gene structure, sequence relatedness, C-terminal sequence DONG YUL SUNG 's thesis for doctor degreee , 2001,CHARACTERIZATION OF ARABIDOPSIS HEAT SHOCK PROTEIN 70 (HSP70) GENE FAMILY AND MICROARRAY ANALYSIS OF GENE EXPRESSION IN RESPONSE TO TEMPERATURE EXTREMES. UNIVERSITY OF FLORIDA Plant Physiology, June 2001, Vol. 126, pp. 789–800 Comprehensive Expression Profile Analysis of the Arabidopsis Hsp70 Gene Family1 Dong Yul Sung, Elizabeth Vierling, and Charles L. Guy* |
8楼2011-03-15 07:44:44
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非常感谢指点 我会好好看下这篇文章的 这个帖子发了很久了，不能加BB了，嘿嘿。 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2951781 这个我灌水的 可以追加 邀请你过来领红包～～ 呼呼～～   |
9楼2011-03-15 20:43:13
