24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 2312  |  回复: 11
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

houxuben

木虫 (正式写手)

MEDCHEM03

[交流] 【讨论】autodock 对接时间问题 已有2人参与

请教个问题,大家做autodock时,对接一次一般用多久?

我做了几个蛋白靶点的dock,发现好慢啊,在(ubuntu10.0;双核2.0Hz)电脑上一般得2~3个小时。。。。不知道是跟机器有关还是本身就这样?
另外有用autodock做虚拟筛选的虫友吗?帮忙考察下这个配置的可行性。。。Intel 5600,80刀的服务器,不胜感谢!
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

分子对接问题锦集

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

houxuben

木虫 (正式写手)

MEDCHEM03

引用回帖:
Originally posted by zh1987hs at 2010-12-25 21:21:57:

呵呵~俺们没有工作站,只能自己用单机计算了~AD上有问题俺们多交流~我也做过一段时间的AD

我这也很纠结啊,又不是学计算机的,搞懂linux就挺费劲了,想着用别人写的脚本做AD的虚筛,看着就头疼。。。。
7楼2010-12-25 23:06:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 12 个回答

houxuben

木虫 (正式写手)

MEDCHEM03

自己顶一下。。。。。人气惨淡。。。
2楼2010-12-24 23:02:27
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

houxuben

木虫 (正式写手)

MEDCHEM03

无语了。。。。难道没有做过的?算了,还是用gold和MVD吧
3楼2010-12-25 08:52:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by houxuben at 2010-12-24 18:43:32:
请教个问题,大家做autodock时,对接一次一般用多久?

我做了几个蛋白靶点的dock,发现好慢啊,在(ubuntu10.0;双核2.0Hz)电脑上一般得2~3个小时。。。。不知道是跟机器有关还是本身就这样?
另外有用autodo ...

ubuntu10.04,I3, 286个残基的蛋白,grid间距默认值,配体三个柔性键,30min
4楼2010-12-25 10:09:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 化工调剂求导师收留!一志愿失利,踏实肯干,有植物提取科研经历 +12 yzyzx 2026-04-09 12/600 2026-04-10 08:46 by yongzhesheng
[考研] 307求调剂 +4 tzq94092 2026-04-10 4/200 2026-04-10 08:29 by 紫曦紫棋
[考研] 还有化工二轮调剂的学校吗 5+11 化工人999 2026-04-09 41/2050 2026-04-10 07:37 by chixmc
[考研] 086003调剂求助 +19 苏弋万 2026-04-09 20/1000 2026-04-09 20:48 by bljnqdcc
[考研] 一志愿0703化学招61最终排名62化学求调剂 +16 招61排名62 2026-04-07 19/950 2026-04-09 20:44 by zhouxiaoyu
[考研] 289求调剂 +4 L1ttleTiger 2026-04-04 4/200 2026-04-09 19:53 by xiayizhi
[考研] 一志愿上海大学生物学346 +4 上海大学346调剂 2026-04-03 4/200 2026-04-09 10:52 by yiminglu
[考研] 一志愿0807 数一英一 313 有没有二轮调剂 +11 emokidd 2026-04-08 12/600 2026-04-09 09:24 by wyf236
[考研] 求调剂 +15 熊二想上岸 2026-04-04 15/750 2026-04-08 22:52 by 猪会飞
[考研] 266求调剂 +5 08电气工程 2026-04-03 5/250 2026-04-08 20:22 by 逆水乘风
[考研] 材料调剂 +4 hzhahg 2026-04-06 4/200 2026-04-08 16:20 by luoyongfeng
[考研] 一志愿211,化学学硕,310分,本科重点双非,求调剂 +10 努力奋斗112 2026-04-07 10/500 2026-04-08 15:01 by screening
[考研] 调剂求助(生物与医药) +6 @6952 2026-04-06 6/300 2026-04-07 23:52 by lys0704
[考研] 生物调剂 +5 橙子橙子橙子啊 2026-04-05 9/450 2026-04-07 15:31 by 上岸快快
[考研] 293求调剂 +3 勇远库爱314 2026-04-06 3/150 2026-04-07 11:15 by hugr
[考研] 307求调剂 +3 所念及所望 2026-04-06 3/150 2026-04-06 17:30 by 土木硕士招生
[考研] 考研调剂 +5 美丽的youth_ 2026-04-04 6/300 2026-04-06 06:57 by houyaoxu
[考研] 化学357分,考研调剂 +11 .Starry. 2026-04-04 12/600 2026-04-06 06:28 by houyaoxu
[考研] 材料调剂 +7 dxy调剂 2026-04-04 7/350 2026-04-05 09:15 by 陌秋26
[考研] 可跨专业调剂 +3 周的得地 2026-04-04 6/300 2026-04-04 22:21 by barlinike
信息提示
请填处理意见