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【求助】分子对接软件到底哪个好？
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我想研究，2个分子间相互作用和情况，比如：杯芳烃和氨基酸。希望能找到能够使它们docking的软件。docking 常用软件有：Dock, Auto Dock, surflex, glide ,gold, MVD...但大部分都是针对蛋白质和小分子作用的，我的体系不大。 我找了Auto Dock4.02 试了一下，杯芳烃和氨基酸能组装好，但是2个乙酸就不对了。MVD号称最好，还没试。J. Chem. Inf. Model. 2009, 49, 1455–1474 评测文章又说surflex最好。迷惑啊。。。令人气愤的是都说的是蛋白质和小分子，或者蛋白质和蛋白质，难道2个有机分子，或者其他高分子就不行？ 郁闷啊！！ 希望高手能指点迷津，推荐适合较小体系，比较准确的docking软件。 [ Last edited by ghcacj on 2010-12-23 at 15:29 ] |
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 分子对接问题锦集 |
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ufo1977(金币+1):谢谢参与 2010-12-23 18:36:42
ghcacj(金币+2):谢谢 2011-01-13 11:48:31
ufo1977(金币+1):谢谢参与 2010-12-23 18:36:42
ghcacj(金币+2):谢谢 2011-01-13 11:48:31
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2楼2010-12-23 16:47:39
3楼2010-12-23 18:35:38
★ ★ ★
ufo1977(金币+1):其实你也没说什么，我只是要求推荐一个软件而已，看来你也没玩过，呵呵。谢谢参与！ 2010-12-23 21:43:09
ghcacj(金币+3):谢谢 2011-01-13 11:49:14
ufo1977(金币+1):其实你也没说什么，我只是要求推荐一个软件而已，看来你也没玩过，呵呵。谢谢参与！ 2010-12-23 21:43:09
ghcacj(金币+3):谢谢 2011-01-13 11:49:14
| 内容已删除 |
4楼2010-12-23 19:16:37
★ ★ ★ ★ ★ ★
zh1987hs(金币+3):谢谢 2010-12-25 23:06:00
zh1987hs(金币+3):谢谢 2010-12-25 23:06:32
zh1987hs(金币+3):谢谢 2010-12-25 23:06:00
zh1987hs(金币+3):谢谢 2010-12-25 23:06:32
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本帖内容被屏蔽 |
5楼2010-12-23 20:48:00
6楼2010-12-23 22:00:46
7楼2010-12-24 10:26:39
★ ★ ★
zh1987hs(金币+3):谢谢 2010-12-25 23:06:29
ufo1977(金币+2):估计只能如此了，谢谢！我在想：为什么我老是想到一些大家都不想的问题呢，我的问题老没能解决掉，难道我太非主流，不应该啊！ 2010-12-31 05:04:58
zh1987hs(金币+3):谢谢 2010-12-25 23:06:29
ufo1977(金币+2):估计只能如此了，谢谢！我在想：为什么我老是想到一些大家都不想的问题呢，我的问题老没能解决掉，难道我太非主流，不应该啊！ 2010-12-31 05:04:58
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
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