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vip_zzc

铜虫 (小有名气)

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[交流] 【讨论】(请教！！)请问有没有哪一种对接软件比较适合做蛋白与RNA的对接呢？？

大家好：
   本人最近遇到一个问题，需要得到一个蛋白与RNA的复合物结构，然后才能进行后续工作。
   RNA：30nt 有结构坐标
   蛋白：80-100 aa 也有坐标，不过据实验报道柔性比较大。

现在大多对接软件基本是针对蛋白与蛋白或蛋白与小分子的，貌似蛋白-RNA的对接效果不
太理想。。请问你们有没有做过类似的工作，或者比较而言，觉得哪种类型对接软件最适合
上述体系呢。。

本来想用一下AutoDock4做一个的,不过被师兄否定了,觉得不太可靠,现在也不知道下步该
怎么走了..

非常感激大家的帮助...........

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1楼 2010-12-10 22:45:15

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caixin5120

木虫 (正式写手)

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★ ★
zh1987hs(金币+2):谢谢 2010-12-11 23:06:27
vip_zzc(金币+1):恩。感谢你的提议，不过有支撑依据吗。如果能提供相关说明就好了。。 2010-12-12 15:18:41
vip_zzc(金币+1):能具体点吗？ 2010-12-19 18:03:49

DS 的ZDOCK 可以实现，不过是商业软件。