24小时热门版块排行榜

返回列表

vip_zzc

铜虫 (小有名气)

应助: 1 (幼儿园)
金币: 105
帖子: 87
在线: 49小时
虫号: 758728

[交流] 【讨论】(请教！！)请问有没有哪一种对接软件比较适合做蛋白与RNA的对接呢？？

大家好：
   本人最近遇到一个问题，需要得到一个蛋白与RNA的复合物结构，然后才能进行后续工作。
   RNA：30nt 有结构坐标
   蛋白：80-100 aa 也有坐标，不过据实验报道柔性比较大。

现在大多对接软件基本是针对蛋白与蛋白或蛋白与小分子的，貌似蛋白-RNA的对接效果不
太理想。。请问你们有没有做过类似的工作，或者比较而言，觉得哪种类型对接软件最适合
上述体系呢。。

本来想用一下AutoDock4做一个的,不过被师兄否定了,觉得不太可靠,现在也不知道下步该
怎么走了..

非常感激大家的帮助...........

回复此楼

» 猜你喜欢

面上项目申报已经有3人回复
有时候真觉得大城市人没有县城人甚至个体户幸福已经有5人回复
酰胺脱乙酰基已经有9人回复
CSC & MSCA 博洛尼亚大学能源材料课题组博士/博士后招生｜MSCA经费充足、排名优已经有5人回复
有70后还继续奋斗在职场上的吗？已经有6人回复
博士延得我，科研能力直往上蹿已经有7人回复
退学或坚持读已经有27人回复
面上基金申报没有其他的参与者成吗已经有5人回复
遇见不省心的家人很难过已经有22人回复

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

提取RNA电泳上样量已经有21人回复
如何验证RNA是否与蛋白质发生相互作用？已经有8人回复
昆虫RNA 提取！电泳图，看不懂！请高手指点！已经有9人回复
如何快速找到所有膜蛋白已经有20人回复
柞蚕总RNA提取中，蛋白抽提不尽已经有12人回复
RNA浓度好低适合做RT-PCR吗？已经有7人回复
【求助】分子对接软件到底哪个好？已经有13人回复
【专题】各位看看我提取的ＲＮＡ怎么样啊已经有24人回复
【分享】大连化物所蛋白质和RNA复合物相互作用的研究工作取得新进展已经有10人回复

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴

1楼 2010-12-10 22:45:15

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

caixin5120

木虫 (正式写手)

模拟EPI: 1
应助: 46 (小学生)
金币: 5.9
帖子: 483
在线: 158.3小时
虫号: 576460

★ ★
zh1987hs(金币+2):谢谢 2010-12-11 23:06:27
vip_zzc(金币+1):恩。感谢你的提议，不过有支撑依据吗。如果能提供相关说明就好了。。 2010-12-12 15:18:41
vip_zzc(金币+1):能具体点吗？ 2010-12-19 18:03:49

DS 的ZDOCK 可以实现，不过是商业软件。