| 查看: 1456 | 回复: 12 | |||
[交流]
【求助/交流】蛋白质与蛋白质的关系研究
|
|||
|
实验现象：实验中发现某细胞病理中有几种细胞骨架蛋白被降解了，同时也通过蛋白杂交和酶活测定发现了几种蛋白酶的活化。 求助交流问题1: 那么我能通过怎样的实验设计，或者通过哪些蛋白质与蛋白质的关系数据库能找到是哪种具体的酶降解了哪种具体的蛋白？（记得以前听说有做生物信息的同学，专门做数据库，只要输入两种蛋白氨基酸序列，就能预测它们关系的） 求助交流问题2: 前面所指的数据库查到的蛋白相互作用关系，除了纯化酶和底物进行孵育，然后进行测序实验外，是否还有其他渠道和设计去证明这些关系？ 求助交流问题3: 我能否通过蛋白杂交的方式，把印迹出来的条带挖下来洗洗，打质谱得到氨基酸序列啊？如果不能，是否应该通过二维电泳，然后做斑点印迹再挖胶吗？ [ Last edited by meizhou on 2010-12-6 at 18:48 ] |
回复此楼» 猜你喜欢
不合理蛙科研实验中的趣事：实验器材的 “乌龙”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验中的趣事：和实验材料的 “斗智斗勇”
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有110人回复
-
蛋白质检测：精准分析，解锁生物分子的密码
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之小鼠实验：严谨设计，解析生命机制的重要载体
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之重金属检测：精准筛查，守护健康与环境的防线
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“蛙测重金属我背锅三千”
已经有0人回复
-
不合理蛙科研实验之“鼠逃三次我发三篇SCI”
已经有0人回复
-
纳米粒度分析
已经有3人回复
-
林科院林化所招收材料与化工专业硕士，坐标南京
已经有0人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 蛋白质与蛋白质互作研究方法
已经有495人回复
- 因为要研究蛋白质相互作用，求protein binding相关的protocol ！！
已经有9人回复
- 蛋白质多聚体的形成与pH变化有什么关系呢？
已经有7人回复
- 十二烷基磺酸钠与蛋白质的关系。
已经有5人回复
- 求蛋白质相互作用研究方法...
已经有12人回复
- 有关蛋白质的文献翻译
已经有3人回复
- 有关蛋白质的问题
已经有12人回复
- 【求助】求解释：荧光光谱法研究变性剂对蛋白质构象影响，峰强变而峰位不发生变化的可
已经有7人回复
- 蛋白质与蛋白质的关系研究
已经有5人回复
- 【分享】德国研究显示绿茶成分可解蛋白质异常沉积毒性
已经有3人回复
- 研究思路--ChIP与蛋白质组研究（已搜索 无重复）
已经有17人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
崂山国家实验室博士后岗位招聘
+2/220
-
【技术服务】研究所横向技术开发及服务
+1/99
-
西北工业大学光子学研究团队诚聘博士后！
+2/58
-
2026年重庆工商大学管理科学与工程专业学术硕士招生调剂，风景总在柳暗花明处
+1/37
-
招硕士调剂生
+2/36
-
南开大学罗景山教授课题组招聘博士后（光/电催化、钙钛矿光伏方向）
+2/34
-
清华大学环境学院贺克斌院士团队招聘博士后
+1/33
-
招收调剂化学工程、计算机、资源与环境专业的研究生，调剂名额4-6名。
+1/33
-
2026年工科硕士调剂-上海大学全国重点实验室团队-材料数据挖掘方向-研究生3-5人
+1/32
-
西安建筑科技大学，樊重庆课题组招收调剂研究生1名。
+2/28
-
瑞典林雪平大学（linköping university）诚聘 氮化物基无机材料方向 博士后1名
+1/27
-
南京医科大学-膜蛋白结构与功能课题组-招收2026级博士研究生
+1/16
-
上海交通大学药学院高杨课题组诚聘博士后
+1/14
-
江苏大学环境学院课题组长期接收学硕专硕
+1/12
-
（国家级人才团队 ）医药与生物技术方向 “申请-考核”制博士研究生招生
+1/8
-
英国埃克塞特大学 & 法国巴黎萨克雷大学联合培养博士
+1/8
-
博士后招聘（高薪40万+）
+1/8
-
青岛科技大学可持续高分子团队 考研招生
+1/8
-
【第三轮招生】澳科大诚招2026年秋季硕士研究生（3月31日下午18:00截止）
+1/4
-
欢迎报考浙江工业大学埃克塞特联合学院硕士研究生
+1/2
2楼2010-12-07 08:59:55
5楼2010-12-09 23:09:55
6楼2010-12-09 23:57:11
7楼2010-12-10 10:30:09
8楼2010-12-10 11:46:11
9楼2010-12-10 11:49:49
★ ★ ★
meizhou(金币+20):谢谢哥们 2010-12-10 12:31:10
dhd997(金币+3):good 2010-12-10 14:33:42
meizhou(金币+20):谢谢哥们 2010-12-10 12:31:10
dhd997(金币+3):good 2010-12-10 14:33:42
|
没有做过，帮你出出主意： 实验现象：实验中发现某细胞病理中有几种细胞骨架蛋白被降解了，同时也通过蛋白杂交和酶活测定发现了几种蛋白酶的活化。 求助交流问题1: 那么我能通过怎样的实验设计，或者通过哪些蛋白质与蛋白质的关系数据库能找到是哪种具体的酶降解了哪种具体的蛋白？（记得以前听说有做生物信息的同学，专门做数据库，只要输入两种蛋白氨基酸序列，就能预测它们关系的） 就是说你要看看能不能将骨架蛋白和你测到的蛋白酶能不能联系起来。 既然你已经知道是骨架蛋白，同多对你研究材料的了解，想必你能得到有关氨基酸序列，同样的道理你也能找到蛋白酶的信息，通过生物信息学的确可以进行预测，蛋白酶的各种结构域，但是推测的理论上的关系。 看来你也知道生物信息学，还处于发展阶段。 求助交流问题2: 前面所指的数据库查到的蛋白相互作用关系，除了纯化酶和底物进行孵育，然后进行测序实验外，是否还有其他渠道和设计去证明这些关系？ 前面通过理论分析，下面是试验阶段。 纯化酶不是很必要，前提如果你已经知道有办法检测， 是否降解。 比如通过预测得到蛋白酶的催化位点：比如是Gly-Glu*-pro。那么你可以通过化学方方法对你的骨架蛋白进行甲基，或者其他修饰方法（生物素）进行标记，酶切后看结果。另外你可以先对你的蛋白酶行进确认研究，通过对已知蛋白（如ABS）进行验证。验证方法同上，然后再对你的骨架蛋白进行研究。 求助交流问题3: 我能否通过蛋白杂交的方式，把印迹出来的条带挖下来洗洗，打质谱得到氨基酸序列啊？如果不能，是否应该通过二维电泳，然后做斑点印迹再挖胶吗？ 此法就为直接，有效。无论是是否进行双向电用，能够拿到分离骨架蛋白就行。 通过对你的蛋白酶进行同位素标记，利用质谱，TOF 或者ion trap 有ETD最好，可以获得蛋白酶的定量信息作为辅助信息。通过分析酶，骨架蛋白的复合体，就能知道骨架蛋白的aa 序列。通常2-5多肽就能确定一个蛋白了。 |
10楼2010-12-10 12:00:02
11楼2010-12-10 12:11:55
12楼2010-12-10 12:28:31
13楼2010-12-10 13:59:11
简单回复
meizhou3楼
2010-12-08 11:02
回复
meizhou4楼
2010-12-09 21:55
回复
