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meizhou

木虫 (知名作家)

[交流] 【求助/交流】蛋白质与蛋白质的关系研究

实验现象：实验中发现某细胞病理中有几种细胞骨架蛋白被降解了，同时也通过蛋白杂交和酶活测定发现了几种蛋白酶的活化。
求助交流问题1: 那么我能通过怎样的实验设计，或者通过哪些蛋白质与蛋白质的关系数据库能找到是哪种具体的酶降解了哪种具体的蛋白？（记得以前听说有做生物信息的同学，专门做数据库，只要输入两种蛋白氨基酸序列，就能预测它们关系的）
求助交流问题2: 前面所指的数据库查到的蛋白相互作用关系，除了纯化酶和底物进行孵育，然后进行测序实验外，是否还有其他渠道和设计去证明这些关系？
求助交流问题3: 我能否通过蛋白杂交的方式，把印迹出来的条带挖下来洗洗，打质谱得到氨基酸序列啊？如果不能，是否应该通过二维电泳，然后做斑点印迹再挖胶吗？

[ Last edited by meizhou on 2010-12-6 at 18:48 ]
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1楼2010-12-06 18:46:15
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scelab

荣誉版主 (文坛精英)
meizhou(金币+1):tx 2010-12-10 17:38:39
哎，帮顶吧~
期待高手
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5楼2010-12-09 23:09:55
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meizhou

木虫 (知名作家)
如果答得好，而且有文献佐证，俺还可以追加金币
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2楼2010-12-07 08:59:55
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)
meizhou(金币+3):是降解，在western blot上显示出现了小片段 2010-12-10 10:22:13
骨架蛋白被降解？
还是说解聚呢？
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6楼2010-12-09 23:57:11
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)
meizhou(金币+10):谢谢 2010-12-10 11:42:50
问题1：我相信已经有些文献已经报道了这些蛋白酶和骨架的关系，你可以去查查

问题2：in vitro的生化反应是一个证据，同时你可以过表达或者干扰该蛋白酶，看能不能在非病理状态下引起降解或阻断病理模型的降解

问题3：其实做这个的意图是……？
赞一下 回复此楼
7楼2010-12-10 10:30:09
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