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xwsooo

银虫 (小有名气)

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[交流] 【求助/交流】引物设计的序列选择问题

各位虫虫好，我现在正在设计引物，也找了一些资料看，现在有一点疑惑:
使用primer5.0软件打开 DNA NEW SEQUENCE，这个序列是指基因的CDS ,还是mRNA,还是fasta sequcence 呢？

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1楼 2010-12-05 11:11:53

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hyw1989960

木虫 (正式写手)

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★ ★
rainwander(金币+2):欢迎积极参与交流。 2010-12-05 17:47:11
xwsooo(金币+1): 2010-12-05 19:53:01

引用回帖:

Originally posted by xwsooo at 2010-12-05 17:02:58:

我师姐做普通PCR时用的是fasta 序列，这又有什么区别呢？
那如果设计AS-PCR的引物应该用什么序列呢？

fasta序列格式是blast组织数据的基本格式，无论是数据库还是查询序列，大多数情况都使用fasta序列格式，如：>gi|187608668|ref|NM_001043364.2| Bombyx mori moricin (Mor), mRNA
http://apps.hi.baidu.com/share/d ... DNA序列还是基因序列