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xwsooo

银虫 (小有名气)


[交流] 【求助/交流】引物设计的 序列选择问题

各位虫虫好,我现在正在设计引物,也找了一些资料看,现在有一点疑惑:
使用primer5.0软件打开 DNA NEW SEQUENCE,这个序列是指基因的CDS ,还是mRNA,还是fasta sequcence 呢?
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hyw1989960

木虫 (正式写手)


xwsooo(金币+1):谢谢交流 2010-12-05 16:58:49
CDS和mRNA序列是一样的,ncbi中mRNA序列没有U都是用T代替的。所以设计引物时两者都行
4楼2010-12-05 16:52:24
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应该是直接的DNA序列,而不是mRNA
2楼2010-12-05 12:17:39
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xwsooo

银虫 (小有名气)


引用回帖:
Originally posted by yuanzhiqin.119 at 2010-12-05 12:17:39:
应该是直接的DNA序列,而不是mRNA

可是我看到就在这个版块里的引物设计专题中巢式pcr的引物设计就有用到mRNA序列的啊。。。
3楼2010-12-05 15:52:14
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hyw1989960

木虫 (正式写手)


xwsooo(金币+1):谢谢 2010-12-05 16:59:08
mRNA其实比CDS要长一些,因为MRNA中还有调控区,中间的从起始密码子到终止密码子就是CDS序列
5楼2010-12-05 16:54:31
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