应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】引物设计
81/1返回列表
查看: 709  |  回复: 7
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

lij2

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】引物设计

想针对乳球菌16srDNA特异片段做荧光定量PCR，把序列发给宝生物的说设计不出来。哭~~~~~~~~序列如下：
AGAGTTTGATCCTGGCTCAGGACGAACGCTGGCGGCGTGCCTAATACATGCAAGTTGAGCGATGAAGATTGGTGCTTGCACCAATTTGAAGAGCAGCGAACGGGTGAGTAACGCGTGGGGAATCTGCCTTTGAGCGGGGGACAACATTTGGAAACGAATGCTAATACCGCATAATAACTTTAAACATAAGTTTTAAGTTTGAAAGATGCAATTGCATCACTCAAAGATGATCCCGCGTTGTATTAGCTAGTTGGTGAGGTAAAGGCTCACCAAGGCGATGATACATAGCCGACCTGAGAGGGTGATCGGCCACATTGGGACTGAGACACGGCCCAAACTCCTACGGGAGGCAGCAGTAGGGAATCTTCGGCAATGGACGAAAGTCTGACCGAGCAACGCCGCGTGAGTGAAGAAGGTTTTCGGATCGTAAAACTCTGTTGGTAGAGAAGAACGTTGGTGAGAGTGGAAAGCTCATCAAGTGACGGTAACTACCCAGAAAGGGACGGCTAACTACGTGCCAGCAGCCGCGGTAATACGTAGGTCCCGAGCGTTGTCCGGATTTATTGGGCGTAAAGCGAGCGCAGGTGGTTTATTAAGTCTGGTGTAAAAGGCAGTGGCTCAACCATTGTATGCATTGGAAACTGGTAGACTTGAGTGCAGGAGAGGAGAGTGGAATTCCATGTGTAGCGGTGAAATGCGTAGATATATGGAGGAACACCGGTGGCGAAAGCGGCTCTCTGGCCTGTAACTGACACTGAGGCTCGAAAGCGTGGGGAGCAAACAGGATTAGATACCCTGGTAGTCCACGCCGTAAACGATGAGTGCTAGATGTAGGGAGCTATAAGTTCTCTGTATCGCAGCTAACGCAATAAGCACTCCGCCTGGGGAGTACGACCGCAAGGTTGAAACTCAAAGGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGAAGCAACGCGAAGAACCTTACCAGGTCTTGACATACTCGTGCTATTCCTAGAGATAGGAAGTTCCTTCGGGACACGGGATACAGGTGGTGCATGGTTGTCGTCAGCTCGTGTCGTGAGATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCCTATTGTTAGTTGCCATCATTAAGTTGGGCACTCTAACGAGACTGCCGGTGATAAACCGGAGGAAGGTGGGGATGACGTCAAATCATCATGCCCCTTATGACCTGGGCTACACACGTGCTACAATGGATGGTACAACGAGTCGCGAGACAGTGATGTTTAGCTAATCTCTTAAAACCATTCTCAGTTCGGATTGTAGGCTGCAACTCGCCTACATGAAGTCGGAATCGCTAGTAATCGCGGATCAGCACGCCGCGGTGAATACGTTCCCGGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACACCACGGGAGTTGGGAGTACCCGAAGTAGGTTGCCTAACCGCAAGGAGGGCGCTTCCTAAGGTAAGACCGATGACTGGGGTGAAGTCGTAACAAGGTA
请高手帮忙看看，真的没法设计特异引物和探针吗？
谢谢~
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2010-11-30 12:43:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

bigbangrex

铁杆木虫 (小有名气)
lij2(金币+1):如果实在没发设计探针就只有用染料了 2010-11-30 19:10:02
一定要设计探针吗，sybrgreen的可以不
赞一下 回复此楼
2楼2010-11-30 13:20:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhaohq1209

铁杆木虫 (著名写手)
★
dhd997(金币+1):热心鼓励 2010-11-30 14:57:07
lij2(金币+1):16s不是每个种都有特异部分吗？在特异区域设计的引物不就有特异性吗？ 2010-11-30 19:11:26
lij2(金币+5):多谢了~ 2010-12-02 13:33:12
16S一般扩增1000bp左右，特异性的引物不好设计，一般都是PCR后测序
赞一下(1人) 回复此楼
3楼2010-11-30 13:29:24
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hyw1989960

木虫 (正式写手)
★
dhd997(金币+1):鼓励交流 2010-11-30 14:57:22
lij2(金币+1):是想在16s特异区设计引物探针，测这种菌的量。可行吗？ 2010-11-30 19:12:42
你想针对16s做荧光定量，还是把他当做内参基因，16s也是很稳定的基因，表达量基本不变化，根本不用做荧光定量吧！内参基因的话倒是可以
赞一下(1人) 回复此楼
4楼2010-11-30 14:52:19
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lij2

金虫 (小有名气)
谢谢楼上几位的热心。继续请教~
赞一下 回复此楼
5楼2010-11-30 19:13:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lij2

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by hyw1989960 at 2010-11-30 14:52:19:
你想针对16s做荧光定量，还是把他当做内参基因，16s也是很稳定的基因，表达量基本不变化，根本不用做荧光定量吧！内参基因的话倒是可以

能设计出特异引物吗？是想测肠道中这种菌的量。可行吗？谢谢~
赞一下 回复此楼
6楼2010-12-01 12:59:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hyw1989960

木虫 (正式写手)
lij2(金币+5):谢谢一直以来的帮助 2010-12-02 13:30:56
引用回帖:
Originally posted by lij2 at 2010-12-01 12:59:14:

能设计出特异引物吗？是想测肠道中这种菌的量。可行吗？谢谢~

那你首先要看这种菌的16s差异在哪？肠道内细菌的16s同源性很高，测浓度的话还是采用别的方法吧，如果文献有报道的话，你可以参考一下文献
赞一下 回复此楼
7楼2010-12-01 14:13:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

张_小敏

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
你好 我想做乳球菌的属特异性PCR   你那里做过么  做了好几对引物了  特异性都不强  你那里有合适的引物么
赞一下 回复此楼
8楼2016-07-20 16:06:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 lij2 的主题更新
81/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭