24小时热门版块排行榜    

查看: 4159  |  回复: 9
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

堕凡尘

铜虫 (初入文坛)


[交流] 【求助】autodock中PDB转pdbqt格式问题?

我在sybyl以及处理好受体,但是转换时总会出现

error:cannot create the pdbqt file,all atoms do not have an autodock_element field

另外,我在www.pdb.org下载的ER受体pdb格式里面是否都相应有一个配体,我看了论坛里面一些资料,好像都有这个配体,那个在准备对接中是否也要删除。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

» 抢金币啦!回帖就可以得到:

查看全部散金贴

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

cxl墙头草

新虫 (初入文坛)



堕凡尘(金币+1): 谢谢参与
希望知道具体的“把所有原子类型转换为 Autdock4的原子类型”的操作步骤。谢谢您的帮助,非常感谢,困惑了我一个月了
4楼2012-06-14 22:51:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

caixin5120

木虫 (正式写手)



堕凡尘(金币+1):谢谢参与
在使用ADT的时候 把所有原子类型转换为 Autdock4的原子类型就不会报错了!
3楼2010-12-10 00:46:01
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

archiehcd

铜虫 (初入文坛)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
我也想问这个问题的,一直解决不了

[ Last edited by archiehcd on 2012-6-15 at 19:42 ]
5楼2012-06-15 19:40:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

demitrii

禁虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
本帖内容被屏蔽

7楼2012-06-21 09:27:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
普通表情 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿武汉理工材料工程专硕调剂 +7 Doleres 2026-03-19 7/350 2026-03-20 10:39 by EBSD
[考研] 能源材料化学课题组招收硕士研究生8-10名 +5 脱颖而出 2026-03-16 14/700 2026-03-20 09:30 by kkcoco25
[考研] 0856调剂,是学校就去 +7 sllhht 2026-03-19 8/400 2026-03-20 09:30 by 每天只摆一小会
[考研] 0817 化学工程 299分求调剂 有科研经历 有二区文章 +20 rare12345 2026-03-18 20/1000 2026-03-20 08:42 by 无际的草原
[考研] 294求调剂材料与化工专硕 +14 陌の森林 2026-03-18 14/700 2026-03-19 22:38 by 学员8dgXkO
[考研] 生物学调剂招人!!! +3 山海天岚 2026-03-17 4/200 2026-03-19 21:34 by 怎么释怀
[考研] 321求调剂 +8 何润采123 2026-03-18 10/500 2026-03-19 16:46 by 何润采123
[考研] 一志愿天大材料与化工(085600)总分338 +5 蔡大美女 2026-03-13 5/250 2026-03-19 10:44 by 是小刘呀~
[考研] 0817调剂 +3 没有答案_ 2026-03-14 3/150 2026-03-19 09:51 by Xu de nuo
[考研] 0703化学 305求调剂 +4 FY_yy 2026-03-14 4/200 2026-03-19 05:54 by anny19840123
[考研] 0703化学调剂,求各位老师收留 +10 秋有木北 2026-03-14 10/500 2026-03-19 05:52 by anny19840123
[考研] 354求调剂 +4 Tyoumou 2026-03-18 7/350 2026-03-18 21:45 by Tyoumou
[考研] 297求调剂 +8 戏精丹丹丹 2026-03-17 8/400 2026-03-18 14:30 by laoshidan
[考研] 0854,计算机类招收调剂 +3 胡辣汤放糖 2026-03-15 6/300 2026-03-18 12:09 by 上岸上岸……..
[考研] 环境工程调剂 +8 大可digkids 2026-03-16 8/400 2026-03-18 09:36 by zhukairuo
[硕博家园] 湖北工业大学 生命科学与健康学院-课题组招收2026级食品/生物方向硕士 +3 1喜春8 2026-03-17 5/250 2026-03-17 17:18 by ber川cool子
[考研] 一志愿南京大学,080500材料科学与工程,调剂 +4 Jy? 2026-03-16 4/200 2026-03-17 11:02 by gaoqiong
[考研] 304求调剂 +3 曼殊2266 2026-03-14 3/150 2026-03-16 16:39 by houyaoxu
[考研] 085601材料工程315分求调剂 +3 yang_0104 2026-03-15 3/150 2026-03-15 10:58 by peike
[考研] 266求调剂 +4 学员97LZgn 2026-03-13 4/200 2026-03-14 08:37 by zhukairuo
信息提示
请填处理意见