24小时热门版块排行榜    

查看: 2669  |  回复: 13

maxwell1988

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】关于酶切产物连接的一点问题 已有5人参与

最近在做重组基因的连接,但是连了好几次就是连不上。具体是这样的,希望高手帮忙答疑解惑下:
基因(~0.5kb)是单酶切,载体(~5kb)是双酶切,20μl体系,基因载体按摩尔比算的体积比:
基因     2μl
载体     9μl
buffer       2μl  
PDG         2μl   
T4连接酶 5μl
22℃,16h。
之后就是常规的转化了,菌落PCR,单酶切鉴定后发现条带的大小不对,宣告连接失败。
要命的是做了好几次,甚至有次还做了基因载体比例的梯度连接实验,结果还是以失败告终。我想知道问题可能出在了什么地方,有什么地方可以改进的,望各位大侠们不比吝赐教!!!
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

perfectpig向前冲!别犹豫!
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhwenxing

木虫 (著名写手)

尛森蟲

★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
lstt09nk(金币+5):全面,细心 2010-11-19 10:44:48
1、连接片段和载体的比例,不是按照ul来计算,是数量比,mol数!!!

2、500bp的片段连接载体是不成问题的。关键在于:切出来的末端是否和载体的缺刻正好相对?

3、不知道你的切点是平末端还是粘末端?前者是否需要脱磷处理,以提高连接效率?

4、不知用的是哪个公司的产品,检查是否过期等。连接酶5uL???这是带buffer吗?如果不是,是不是浓度太高了?甘油就能够完全抑制活性了。

5、22℃连接16h是否太长了?我经常用到的是4℃,2天;   16℃,30-50min;  22℃,2-5h……

6、建议按照说明书来做,做前仔细计算好体系,到底加多少!酶切的产物是否纯化了?纯化后溶解液是什么?是否检测浓度了?酶切后的载体是否存在自连??

多数以反问的形式回答楼主,希望能有帮助。
2楼2010-11-19 10:23:35
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

skkyy88888

铜虫 (著名写手)

★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
基因(~0.5kb)是单酶切,载体(~5kb)是双酶切???

这个怎么连呢?先把酶切位点搞清楚再做吧。
3楼2010-11-19 12:11:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zgb1982

木虫 (正式写手)

★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
首先,LZ说了是按mol数换算的体积,2楼没看清楚就说人家啊。
其他的倒都是问题,LZ考虑下吧,你都没说清楚
4楼2010-11-19 13:22:15
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhwenxing

木虫 (著名写手)

尛森蟲

★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by zgb1982 at 2010-11-19 13:22:15:
首先,LZ说了是按mol数换算的体积,2楼没看清楚就说人家啊。
其他的倒都是问题,LZ考虑下吧,你都没说清楚

哦,偶买噶。sorry,的确没看清最后一句。谢谢提醒。觉得这个反应体系不太对头,混合后缓冲液的成分就有些不太对头的感觉。
5楼2010-11-19 17:51:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

maxwell1988

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by skkyy88888 at 2010-11-19 12:11:46:
基因(~0.5kb)是单酶切,载体(~5kb)是双酶切???

这个怎么连呢?先把酶切位点搞清楚再做吧。

额。。。用的是一种改造后的载体,载体是要双酶切,而基因是单酶切,为了防止载体自身环化,所以酶切后有一端是平末端,不过还是谢谢你的解答!
perfectpig向前冲!别犹豫!
6楼2010-11-20 21:50:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

maxwell1988

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by zgb1982 at 2010-11-19 13:22:15:
首先,LZ说了是按mol数换算的体积,2楼没看清楚就说人家啊。
其他的倒都是问题,LZ考虑下吧,你都没说清楚

谢谢解答,连接后转化,平板上长菌了,但是做了菌落PCR,单酶切后发现载体大小不对,这点让我比较郁闷,这种载体在设计时已经避免了载体自连了,那为什么平板上会有菌长出呢?
perfectpig向前冲!别犹豫!
7楼2010-11-20 21:53:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

maxwell1988

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by zhwenxing at 2010-11-19 10:23:35:
1、连接片段和载体的比例,不是按照ul来计算,是数量比,mol数!!!

2、500bp的片段连接载体是不成问题的。关键在于:切出来的末端是否和载体的缺刻正好相对?

3、不知道你的切点是平末端还是粘末端?前者 ...

谢谢了,您说的问题之前我大都做了分析了,酶没问题,因为实验室其他人用同样的体系连上了。。。
perfectpig向前冲!别犹豫!
8楼2010-11-20 21:56:43
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yzuxhq368

金虫 (小有名气)

★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
不知你酶切完了是切胶回收的还是纯化回收。前者连接效率低,后者有质粒切不完全,会有假阳性。可分几管分别酶切,然后合并回收。
9楼2010-11-20 23:01:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

skkyy88888

铜虫 (著名写手)

★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
引用回帖:
Originally posted by maxwell1988 at 2010-11-20 21:50:42:

额。。。用的是一种改造后的载体,载体是要双酶切,而基因是单酶切,为了防止载体自身环化,所以酶切后有一端是平末端,不过还是谢谢你的解答!

怪不得你连不上了,载体一端是平末端,但你的基因都是粘性末端,不可能连上的。你应该都是单酶切后,载体做去磷酸化处理来避免载体自连。
10楼2010-11-21 08:43:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 maxwell1988 的主题更新
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 上海工程技术大学 激光智能制造课题组 2027级博士研究生招生 +5 oxidpl 2026-09-20 7/350 2026-09-27 10:43 by Equinoxhua
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 ViqFlLSxHDGt 2026-09-26 3/150 2026-09-27 10:26 by 4IW0sJvtEqX8
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 ViqFlLSxHDGt 2026-09-26 3/150 2026-09-27 10:21 by 4IW0sJvtEqX8
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 ViqFlLSxHDGt 2026-09-26 3/150 2026-09-27 10:15 by 4IW0sJvtEqX8
[考博] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 ViqFlLSxHDGt 2026-09-26 3/150 2026-09-27 10:03 by 4IW0sJvtEqX8
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 oeyPlfmMUpOC 2026-09-26 3/150 2026-09-27 09:13 by 4IW0sJvtEqX8
[公派出国] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +3 GxESXJmptOtQ 2026-09-25 4/200 2026-09-27 06:44 by XgCC8uTcwILl
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 GxESXJmptOtQ 2026-09-25 4/200 2026-09-27 06:39 by XgCC8uTcwILl
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +3 GxESXJmptOtQ 2026-09-25 3/150 2026-09-27 06:32 by XgCC8uTcwILl
[找工作] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 3/150 2026-09-27 06:08 by XgCC8uTcwILl
[公派出国] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +3 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 3/150 2026-09-27 06:05 by XgCC8uTcwILl
[考研] 售一区SCI文章T0P,我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 3/150 2026-09-27 05:56 by XgCC8uTcwILl
[论文投稿] 售SCI一区文章,我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 4/200 2026-09-27 05:56 by XgCC8uTcwILl
[找工作] 售SCI一区文章,我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +5 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 5/250 2026-09-27 05:53 by XgCC8uTcwILl
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O55.1.O.54,科目全,可十急 +4 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 4/200 2026-09-27 05:50 by XgCC8uTcwILl
[公派出国] 售SCI文章,我:8O5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 4/200 2026-09-27 05:44 by XgCC8uTcwILl
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 5/250 2026-09-27 05:44 by XgCC8uTcwILl
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.54,科目全,可伽急 +3 vQZoDrrm7mUF 2026-09-25 6/300 2026-09-27 05:42 by XgCC8uTcwILl
[找工作] 售SCI一区T0P文章,我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 PGTSwSC3F6nQ 2026-09-24 5/250 2026-09-25 11:19 by yhq9807
[有机交流] 有机合成以后会不会被AI改变?做科研的虫友怎么看 +5 zapen 2026-09-20 8/400 2026-09-23 17:21 by tianxiaoxian
信息提示
请填处理意见