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piaoxue001

木虫 (正式写手)

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[交流] 【求助】用vasp搜寻过渡态的请进

VASPer：
      最近学习了一下，vasp搜寻过渡态。
      也是边看边思考我的体系方法的选择及文件的设置。
      很遗憾，依然有一些问题亟待解决？
      请有经验的各位朋友帮忙：

      （1）vasp搜寻过渡态：有人说要装vasp TST tools？是不是编译好的vasp不能跑过渡态？
         （2）关于方法的选择：看到有的文献用NEB方法，请问团簇的表面小分子的吸附用什么方法？能不能推荐几篇文献？我今天查了一篇，是用dmol搜寻的过渡态
         （3）关于vasp搜过渡态所需的文件。
      有人说需要 INCAR POSCAR POTCAR ｛nodelist （应该是KPOINTS吧。昨天看有的认识这样说的）｝
      另外初始和末态的poscar和优化用的POSCAR形式是不是一样，因为没有例子，所以问的详细一点。
         （4）最重要的是INCAR文件的设置，大家参考的是哪方面的资料呢？
         请问IOPT是否在这里设置。看到有人给的INCAR文件是参考vasp TST tools网站的，有人提出按官方网设置，但是官方网没有关于TST的说明。
         （5）

[ Last edited by piaoxue001 on 2010-11-15 at 08:47 ]

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1楼 2010-11-14 15:31:03

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piaoxue001

木虫 (正式写手)

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引用回帖:

Originally posted by zyuea at 2010-11-17 09:58:18:
我现在也正在学习过渡态的计算，也遇到不少问题，对于你说的问题，我个人想法是neb和dimer的方法不在于算什么体系，而在于反应的路径，如果你知道的始末产物和大体的反应路径的话就用neb，如果不清楚反应的机理可 ...

你好请问DIEMR方法中的MODECAR如何生成？ 1 MODECAR的生成需要两个POSCAR，第一个POSCAR可以取初始物，第二个如何取？dimer是对不知道机理的搜索，只给初始构型就可以，为什么还强烈建议给出MODECAR。第二个POSCAR如果给不好，搜索岂不是不准？
2 dimer寻找的是a nearby saddle point，请问对于有多个TS的路径如何搜索呢？

[ Last edited by piaoxue001 on 2010-11-18 at 10:27 ]