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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 【求助/交流】测序问题，求助高手。
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zhaohu200801

新虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】测序问题，求助高手。

做TA克隆时，测序结果只找到上游引物，找不到下游引物。经过BLast，相似度只有30%，不知道什么原因。
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1楼 2010-11-06 11:56:44
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胖无名

金虫 (正式写手)
★ ★ ★
scelab(金币+3):热心虫友，欢迎多来交流~~~:tiger06::tiger28::tiger23: 2010-11-06 23:51:41
zhaohu200801(金币+1):谢谢 2010-11-07 14:19:36
这个原因可多了，1 你测序是测通还是单向，2 克隆的片段多大，如果片段较长而又是单向测序的话，只找到一个引物是不足为奇的，3 送去测序的样品有没有经过酶切验证或菌落PCR验证，4 你是哪家给测的序，测错也不是没有可能
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6楼2010-11-06 22:23:18
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yynzcx

银虫 (小有名气)
恭喜！恭喜！
本文来自: 小木虫论坛 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2565295
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2楼2010-11-06 12:43:14
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yixuanwin

铁杆木虫 (正式写手)
zhaohu200801(金币+1):哦，谢谢 2010-11-06 18:12:06
zhaohu200801(金币+1):再送你一个 2010-11-06 18:21:57
测错了。 我测序也会遇到这样的。 假阳性克隆。
本文来自: 小木虫论坛 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2567462&fpage=1
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3楼2010-11-06 15:01:54
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zhaohu200801

新虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by yixuanwin at 2010-11-06 15:01:54:
测错了。 我测序也会遇到这样的。 假阳性克隆。
本文来自: 小木虫论坛 http://muchong.com/bbs/viewthread.php?tid=2567462&fpage=1

长出来的菌不多，而且还挺小的，那到底是什么原因造成的假阳性克隆啊？是简并引物设计的不对吗？还是模板的问题啊？都研三了，实验做了一年多了还没点进展，急！
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4楼2010-11-06 18:20:38
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