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[交流]
【求助/交流】关于ClusterX多序列比对的问题 已有3人参与
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| 我想构建进化树，要先用ClusterX多序列比对生成*PHY的文件，我想问一下，在用ClusterX做多序列比对时，序列是一个一个输入的嘛？我要比对大概300多个！有没有什么方法可以直接全部输入啊！不会要输300多次吧！ |
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sai00fuji
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小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
amisking(金币+3):鼓励下！ 2010-08-31 21:50:10
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可以把300个序列信息放到一个fasta文件里 就像这个样 >rats gi|1246093|gb|S80431.1| delta 4-3-ketosteroid 5 beta-reductase=37 kda protein [rats, liver, mRNA Partial, 1003 nt] AATTCCGCTACAATGAACCTCAGCACTGCAAACCACCACATACCCCTAAATGATGGTAACAGCATTCCGA >MusmusculusmRna gi|171543884|ref|NM_145364.2| Mus musculus aldo-keto reductase family 1, member D1 (Akr1d1), mRNA TAGGCACCTTTTCAAATAATGTGCCTCTGCCCTGTTCAGAATCACCCCAGAAGCTTCAGATTCTTCTCTA CGATGAACCTCAGCGCTGCACACCACCAAATATCCCTAAGTGATGGGAACAACATTCCACTCATTGGGCT |
2楼2010-08-31 20:43:05
njauzx
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