应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 【求助/交流】关于转录因子的binding site 的 疑问
41/1返回列表
查看: 803  |  回复: 3
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

yanruoke

银虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】关于转录因子的binding site 的 疑问

看到文献中转录因子结合启动子的motif以PWM形式给出，下图所示：数个碱基（A T C G）排成一列，我的问题是为什么有的位置的碱基，如 T ，画的很大，并且单独占个位置，而有的位置的 碱基画的很小，并且是两个碱基上下叠起来，占一个位置？此地的物理意义是？

第二个问题是转录因子和对应的binding site 结合时，偶估计了两种方式：第一种是先结合一个base,然后随着转录的发生，向前滑动，渐次结合到这个motif的其他base上，结合的所有base构成下图中的motif。
第二种结合方式是转录因子直接和组成motif的所有base结合。

PS： PWM is short for position weight matrix.
请行内虫友指教，先行谢过



[ Last edited by yanruoke on 2011-4-12 at 12:19 ]
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2011-04-09 16:33:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hunbingshi

新虫 (初入文坛)
yanruoke(金币+1): 2011-04-26 10:11:11
yanruoke(金币+9): thanks a lot 2011-04-26 10:12:13
please refer to : "From DNA sequence to expression patter"
赞一下 回复此楼
3楼2011-04-25 08:19:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

medjane

新虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
为啥没人回答啊啊啊啊啊啊
赞一下 回复此楼
4楼2016-01-31 22:41:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
维维Vivi2楼
2011-04-12 14:52   回复  
yanruoke(金币+1): 2011-04-13 16:27:57
yanruoke(金币+1): 2011-04-19 10:45:53
相关版块跳转 我要订阅楼主 yanruoke 的主题更新
41/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭