| 查看: 1543 | 回复: 6 | |||
[交流]
【求助】关于转录因子结合点的PWM
|
|
看到文献中转录因子结合启动子的motif以PWM形式给出,有图给出PWM的形式:数个碱基(A T C G)排成一列,我的问题是为什么有的位置的碱基,如 T ,画的很大,并且单独占个位置,而有的位置的 碱基画的很小,并且是两个碱基上下叠起来,占一个位置?此地的物理意义是? 先行谢过 |
» 猜你喜欢
酰胺脱乙酰基
已经有9人回复
有时候真觉得大城市人没有县城人甚至个体户幸福
已经有3人回复
CSC & MSCA 博洛尼亚大学能源材料课题组博士/博士后招生|MSCA经费充足、排名优
已经有5人回复
有70后还继续奋斗在职场上的吗?
已经有6人回复
博士延得我,科研能力直往上蹿
已经有7人回复
退学或坚持读
已经有27人回复
面上基金申报没有其他的参与者成吗
已经有5人回复
遇见不省心的家人很难过
已经有22人回复
» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:
关于发帖要求的几点说明
已经有7人回复
求助~~关于SiC的二元相图
已经有4人回复
关于转录因子调控的下游基因
已经有13人回复
【求助】转录因子方面研究,国外老板已同意,我是我背景很差写不出研究计划。
已经有4人回复
【求助/交流】AP2转录因子有什么功能?
已经有4人回复
【求助/交流】转录因子活性
已经有10人回复
【原创】寻求建议:关于洪堡申请时间和条件以及可行性问题
已经有16人回复
【求助】关于国考中的应届毕业证明
已经有13人回复
以下是三个关于电化学方面的期刊~具体情况想咨询一下有经验的朋友们~
已经有13人回复
» 抢金币啦!回帖就可以得到:
中国科学院深圳先进技术研究院——招聘博士后
+3/113
结构动力学与结构健康监测方向欧盟玛丽居里全奖博士招聘
+1/78
深圳大学信息功能电子材料方向“申请-考核制”博士生招生
+2/44
香港科技大学计算物理及流体力学课题组招收全奖博士后及博士生(2026年9月入学)
+1/43
深圳大学柔性电子材料方向“申请-考核制”博士生招生
+2/36
南方科技大学物理系夏秀杨课题组招收博士生/博士后 计算与理论软物质/生物物理方向
+1/35
南方医科大学生物医学工程学院招收申请考核制博士生2名、博士后2名(2026)
+1/30
山东科技大学招聘化学化工博士博士后
+1/26
新加坡 南洋理工大学- 智能光子/ 传感 PHD 全奖一名 2026 - 8 月入学
+1/24
澳科大药诚招2026年秋季药剂学/生物材料硕士研究生
+1/19
南京医科大学国家级高层次青年人才团队招收博士研究生
+1/11
考博求助
+1/6
澳科大招收2026年秋季入学生物材料方向全奖博士研究生(3月5日截止)
+1/5
加氢裂化
+1/4
澳科大招收2026年秋季入学药剂学/生物材料方向全奖博士研究生
+1/3
哈工大(深圳)物理招收2026年9月入学博士生1个名额
+1/3
山东第一医科大学第一附属医院招聘事业编制科研岗
+1/2
上海理工顾敏院士/李蔚团队招收2026级博士研究生 (集成光学、量子信息方向)
+1/2
海南大学国家优青团队招聘“AI/大数据+材料”方向专任教师(事业编制)
+1/1
双一流联合团队招聘团队青年人才与博后
+1/1
2楼2011-04-09 16:53:45
3楼2011-04-10 16:51:35
yanruoke(金币+5): thanks 2011-04-13 16:28:47
|
the height of symbols within the stack indicates the relative frequency (relative proportion and conserved property) of each amino or nucleic acid at that position. Check the Detail formula with paper ' Sequence Logos: A New Way to Display Consensus Sequences'--the original seq logos publication. |
4楼2011-04-12 20:05:39
5楼2011-04-13 16:38:40
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
reasonspare(金币+2): 谢谢分享 2011-04-14 11:40:16
小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
reasonspare(金币+2): 谢谢分享 2011-04-14 11:40:16
|
呵呵,既然是示意图就不能太当真 我没做过这个DNA-pr结合方面的东西,所以以下说的都是看文章或者是我脑子里有点印象的,不一定完全正确:可能是转录因子先与DNA接触,半结合后触发构象改变,使得结构更加稳定,因此应该是与区域DNA的结合,结合后吸引其他蛋白或者改变局域的DNA构象(例如核小体解离) 所以我倾向于第二种 关于DNA与蛋白结合,前年看过一个science上的文章,说的是核小体与蛋白结合的时候,可以依靠DNA双链小沟上的负电性,吸引核小体上的精氨酸残基,当序列中AT多时,小沟更加狭窄,因此负电性更强;这可能也是一个因素吧 |
6楼2011-04-13 22:19:09
7楼2011-04-14 21:28:04













回复此楼