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[交流]
【求助】关于转录因子结合点的PWM
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看到文献中转录因子结合启动子的motif以PWM形式给出，有图给出PWM的形式：数个碱基（A T C G）排成一列，我的问题是为什么有的位置的碱基，如 T ，画的很大，并且单独占个位置，而有的位置的 碱基画的很小，并且是两个碱基上下叠起来，占一个位置？此地的物理意义是？ 先行谢过 |
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2楼2011-04-09 16:53:45
3楼2011-04-10 16:51:35
yanruoke(金币+5): thanks 2011-04-13 16:28:47
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the height of symbols within the stack indicates the relative frequency (relative proportion and conserved property) of each amino or nucleic acid at that position. Check the Detail formula with paper ' Sequence Logos: A New Way to Display Consensus Sequences'--the original seq logos publication. |
4楼2011-04-12 20:05:39