| 查看: 1618 | 回复: 6 | |||
[交流]
【求助】关于转录因子结合点的PWM
|
|
看到文献中转录因子结合启动子的motif以PWM形式给出，有图给出PWM的形式：数个碱基（A T C G）排成一列，我的问题是为什么有的位置的碱基，如 T ，画的很大，并且单独占个位置，而有的位置的 碱基画的很小，并且是两个碱基上下叠起来，占一个位置？此地的物理意义是？ 先行谢过 |
回复此楼» 猜你喜欢
还有化工二轮调剂的学校吗
已经有18人回复
-
283求调剂
已经有3人回复
-
299求调剂
已经有6人回复
-
材料专硕初试分332一志愿西北工业大学，
已经有8人回复
-
材料工程085601，270求调剂
已经有28人回复
-
297求调剂
已经有21人回复
-
一志愿武理车辆 281 求调剂
已经有4人回复
-
085404 293求调剂
已经有6人回复
-
工科273调剂
已经有4人回复
-
材料295
已经有16人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 关于发帖要求的几点说明
已经有7人回复
- 求助~~关于SiC的二元相图
已经有4人回复
- 关于转录因子调控的下游基因
已经有13人回复
- 【求助】转录因子方面研究，国外老板已同意，我是我背景很差写不出研究计划。
已经有4人回复
- 【求助/交流】AP2转录因子有什么功能？
已经有4人回复
- 【求助/交流】转录因子活性
已经有10人回复
- 【原创】寻求建议：关于洪堡申请时间和条件以及可行性问题
已经有16人回复
- 【求助】关于国考中的应届毕业证明
已经有13人回复
- 以下是三个关于电化学方面的期刊~具体情况想咨询一下有经验的朋友们~
已经有13人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
半导体加工服务
+1/99
-
浙师大化与材学院2026年有大量硕士研究生调剂名额 （线上 调剂）
+1/41
-
湖北大学生科院邢琼老师课题组招硕士/博士,目前还有调剂名额！
+1/40
-
26申博自荐（新能源电池方向）
+1/40
-
扬州大学动物科学与技术学院李碧春教授课题组硕士研究生调剂招生 招生专业： 畜牧学
+1/38
-
济南大学前沿交叉院 招化学学硕（物理可调）或 材料与化工专硕
+1/20
-
汕头大学化学系陈广慧教授课题组招收计算化学方向考研调剂生
+2/16
-
北京理工大学（珠海）招收2026级考核制博士
+1/15
-
重庆科技大学新能源与电子信息材料团队招收化学、物理、材料类调剂生
+1/13
-
★上海★上海工程技术大学·环境与资源创新中心（ICER）接收化工材料环境等学科调剂生
+1/8
-
欢迎调剂佛山大学环境工程（专硕）专业研究生
+1/6
-
Postdoc position in continuum mechanics of brain tissue at KTH in Stockholm
+1/6
-
齐齐哈尔大学李莉课题组诚招2026级考研调剂生（学硕和专硕）
+1/5
-
河南师范大学与中国水产科学院联合培养 招收水产养殖方向调剂硕士生1名
+1/5
-
西京学院土木调剂
+1/5
-
找好工作来我这-广东唯一石化院校——资源与环境专硕招生
+1/5
-
武汉纺织大学材料学院姜伟杰青团队招生
+1/4
-
招收荧光探针/有机合成/生物学博士生
+1/2
-
南阳师范学院生命科学学院2026年硕士研究生调剂最新简明信息
+1/1
-
欢迎对智能材料与结构系统领域感兴趣的在读硕博生前来访学
+1/1
2楼2011-04-09 16:53:45
3楼2011-04-10 16:51:35
yanruoke(金币+5): thanks 2011-04-13 16:28:47
|
the height of symbols within the stack indicates the relative frequency (relative proportion and conserved property) of each amino or nucleic acid at that position. Check the Detail formula with paper ' Sequence Logos: A New Way to Display Consensus Sequences'--the original seq logos publication. |
4楼2011-04-12 20:05:39
5楼2011-04-13 16:38:40
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
reasonspare(金币+2): 谢谢分享 2011-04-14 11:40:16
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
reasonspare(金币+2): 谢谢分享 2011-04-14 11:40:16
|
呵呵，既然是示意图就不能太当真 我没做过这个DNA-pr结合方面的东西，所以以下说的都是看文章或者是我脑子里有点印象的，不一定完全正确：可能是转录因子先与DNA接触，半结合后触发构象改变，使得结构更加稳定，因此应该是与区域DNA的结合，结合后吸引其他蛋白或者改变局域的DNA构象（例如核小体解离） 所以我倾向于第二种 关于DNA与蛋白结合，前年看过一个science上的文章，说的是核小体与蛋白结合的时候，可以依靠DNA双链小沟上的负电性，吸引核小体上的精氨酸残基，当序列中AT多时，小沟更加狭窄，因此负电性更强；这可能也是一个因素吧 |
6楼2011-04-13 22:19:09
7楼2011-04-14 21:28:04
