| 查看: 1664 | 回复: 6 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[交流]
【求助】关于转录因子结合点的PWM
|
|||
|
看到文献中转录因子结合启动子的motif以PWM形式给出，有图给出PWM的形式：数个碱基（A T C G）排成一列，我的问题是为什么有的位置的碱基，如 T ，画的很大，并且单独占个位置，而有的位置的 碱基画的很小，并且是两个碱基上下叠起来，占一个位置？此地的物理意义是？ 先行谢过 |
回复此楼» 猜你喜欢
考博
已经有4人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急
已经有3人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急
已经有3人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急
已经有3人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急
已经有3人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急
已经有3人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急
已经有3人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急
已经有3人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急
已经有3人回复
-
售SCI一区T0P文章，我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急
已经有3人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 关于发帖要求的几点说明
已经有7人回复
- 求助~~关于SiC的二元相图
已经有4人回复
- 关于转录因子调控的下游基因
已经有13人回复
- 【求助】转录因子方面研究，国外老板已同意，我是我背景很差写不出研究计划。
已经有4人回复
- 【求助/交流】AP2转录因子有什么功能？
已经有4人回复
- 【求助/交流】转录因子活性
已经有10人回复
- 【原创】寻求建议：关于洪堡申请时间和条件以及可行性问题
已经有16人回复
- 【求助】关于国考中的应届毕业证明
已经有13人回复
- 以下是三个关于电化学方面的期刊~具体情况想咨询一下有经验的朋友们~
已经有13人回复
» 抢金币啦！回帖就可以得到:
-
西澳大学 环境工程 全奖博士 & 2027 CSC博士招生（接收联培培养博士生）
+1/168
-
电子科技大学（深圳）高等研究院陈明豪课题组招收推免硕士研究生
+1/85
-
北京-89175-事业单位-诚征女友
+1/64
-
google ai pro 会员/gemini分享
+1/37
-
西北工业大学物理科学与技术学院-诚聘【AI与光学交叉方向】博士后
+1/33
-
大湾区大学张国强课题组招聘光催化方向博士后
+1/30
-
坐标南京
+1/29
-
北京大学新材料学院招聘柔性电子方向博士后
+2/16
-
深圳理工大学-湖南大学项目招收钙钛矿方向博士生
+1/15
-
吉林大学任雷课题组招机器人和触觉传感方向2026年入学博士生
+1/14
-
河南省医学科学院王宁利院士科研团队2026年博士、博后、硕士招聘
+1/10
-
招收2026年秋季入学博士生1名（河北工业大学/北京科技大学联合 增材制造/生物材料）
+1/7
-
明尼苏达大学博士后招聘（结构病毒生物学, Prof. Fang Li's lab)
+1/6
-
湘潭大学材料学院“特种化学电源”创新团队补招2026年秋入学博士生
+1/6
-
宁夏大学2026博士招生
+1/6
-
我用DeepSeek和豆包写了三个月论文，最后发现真正好用的不是它们
+1/3
-
郑州大学倪佩楠教授课题组招收2026年9月入学博士
+1/3
-
土木工程--陆工大2026年第二批博士研究生补充招录
+2/2
-
双一流天津工业大学电信学院李鸿强教授招收2026年申请审核制博士
+1/2
-
985院长团队！（大连理工，光电融合芯片方向） 招收2026秋入学博士生 5月初截止！
+1/2
★ ★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
reasonspare(金币+2): 谢谢分享 2011-04-14 11:40:16
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
reasonspare(金币+2): 谢谢分享 2011-04-14 11:40:16
|
呵呵，既然是示意图就不能太当真 我没做过这个DNA-pr结合方面的东西，所以以下说的都是看文章或者是我脑子里有点印象的，不一定完全正确：可能是转录因子先与DNA接触，半结合后触发构象改变，使得结构更加稳定，因此应该是与区域DNA的结合，结合后吸引其他蛋白或者改变局域的DNA构象（例如核小体解离） 所以我倾向于第二种 关于DNA与蛋白结合，前年看过一个science上的文章，说的是核小体与蛋白结合的时候，可以依靠DNA双链小沟上的负电性，吸引核小体上的精氨酸残基，当序列中AT多时，小沟更加狭窄，因此负电性更强；这可能也是一个因素吧 |
6楼2011-04-13 22:19:09
2楼2011-04-09 16:53:45
3楼2011-04-10 16:51:35
yanruoke(金币+5): thanks 2011-04-13 16:28:47
|
the height of symbols within the stack indicates the relative frequency (relative proportion and conserved property) of each amino or nucleic acid at that position. Check the Detail formula with paper ' Sequence Logos: A New Way to Display Consensus Sequences'--the original seq logos publication. |
4楼2011-04-12 20:05:39
