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安静的位置i

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】关于原核基因在真核中表达

原核基因在真核中表达（例如酵母 霉菌）需要进行密码子优化吗？有什么原则吗？比如一般需要优化多少个碱基？是在N端还是C端优化？有哪些好的优化软件？

另，表达异源蛋白是否有必要加融合标签？选择N端还是C端？（不加标签，怕表达量太少，SDS-PAGE检测不到，而Western没有现成的标签，自制抗体很麻烦；加了标签又怕影响蛋白活性，折叠出问题，很矛盾，请高人指点！）
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1楼 2010-09-25 22:55:22
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susizheng

木虫 (著名写手)

我們是糖 甜到憂傷
安静的位置i(金币+5): 2010-09-26 16:40:26
密码子优化有些网站有这样的功能。
如下两个就满足要求。
http://www.jcat.de/
http://www.genscript.com/cgi-bin/tools/rare_codon_analysis
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Thank-you，so-blue.
2楼2010-09-26 10:07:37
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susizheng

木虫 (著名写手)

我們是糖 甜到憂傷
一般要是合成基因的话，直接交给公司优化就可以了。
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Thank-you，so-blue.
3楼2010-09-26 10:08:32
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安静的位置i

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by susizheng at 2010-09-26 10:07:37:
密码子优化有些网站有这样的功能。
如下两个就满足要求。
http://www.jcat.de/
http://www.genscript.com/cgi-bin/tools/rare_codon_analysis

非常感谢，我去看看！
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4楼2010-09-26 13:40:21
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安静的位置i

金虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by susizheng at 2010-09-26 10:08:32:
一般要是合成基因的话，直接交给公司优化就可以了。

那如果不是合成基因呢？原核的基因在真核里表达需要优化吗？
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5楼2010-09-26 13:42:30
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susizheng

木虫 (著名写手)

我們是糖 甜到憂傷
引用回帖:
Originally posted by 安静的位置i at 2010-09-26 13:42:30:

那如果不是合成基因呢？原核的基因在真核里表达需要优化吗？

可能会因为密码子偏爱性对你的表达有影响。
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Thank-you，so-blue.
6楼2010-09-26 15:55:27
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