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安静的位置i

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】关于原核基因在真核中表达

原核基因在真核中表达(例如酵母 霉菌)需要进行密码子优化吗?有什么原则吗?比如一般需要优化多少个碱基?是在N端还是C端优化?有哪些好的优化软件?

另,表达异源蛋白是否有必要加融合标签?选择N端还是C端?(不加标签,怕表达量太少,SDS-PAGE检测不到,而Western没有现成的标签,自制抗体很麻烦;加了标签又怕影响蛋白活性,折叠出问题,很矛盾,请高人指点!)
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susizheng

木虫 (著名写手)

我們是糖 甜到憂傷

安静的位置i(金币+5): 2010-09-26 16:40:26
密码子优化有些网站有这样的功能。
如下两个就满足要求。
http://www.jcat.de/
http://www.genscript.com/cgi-bin/tools/rare_codon_analysis
Thank-you,so-blue.
2楼2010-09-26 10:07:37
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susizheng

木虫 (著名写手)

我們是糖 甜到憂傷

一般要是合成基因的话,直接交给公司优化就可以了。
Thank-you,so-blue.
3楼2010-09-26 10:08:32
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安静的位置i

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by susizheng at 2010-09-26 10:07:37:
密码子优化有些网站有这样的功能。
如下两个就满足要求。
http://www.jcat.de/
http://www.genscript.com/cgi-bin/tools/rare_codon_analysis

非常感谢,我去看看!
4楼2010-09-26 13:40:21
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安静的位置i

金虫 (小有名气)

引用回帖:
Originally posted by susizheng at 2010-09-26 10:08:32:
一般要是合成基因的话,直接交给公司优化就可以了。

那如果不是合成基因呢?原核的基因在真核里表达需要优化吗?
5楼2010-09-26 13:42:30
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susizheng

木虫 (著名写手)

我們是糖 甜到憂傷

引用回帖:
Originally posted by 安静的位置i at 2010-09-26 13:42:30:

那如果不是合成基因呢?原核的基因在真核里表达需要优化吗?

可能会因为密码子偏爱性对你的表达有影响。
Thank-you,so-blue.
6楼2010-09-26 15:55:27
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