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ffrc

金虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】关于DNA提取的问题。请高手赐教已有9人参与

请高手赐教以下问题。
我提DNA过程中,先后用裂解液、饱和酚、酚仿醇(25:24:1)、氯仿、酒精、75%酒精。最后用TE溶解。
此过程没有用RNase。
这个过程提取下来的DNA有RNA干扰,有蛋白残留。
请问如何将这个粗提的DNA纯化。
在哪里加RNase,加多少,如何一步步纯化。
请细告知。谢谢
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rosalie161

金虫 (正式写手)

提取详细


ffrc(金币+1):谢谢参与
ffrc(金币+10):非常详细。巨谢 2010-08-05 10:11:49
(2)        将100ml培养液转移至离心管中,12000rpm离心5min,弃上清。
(3)        加入9.5mlTE悬浮沉淀,并加0.5ml10%SDS,50μl20mg/ml(或1mg干粉)蛋白酶K。混匀37℃保温1小时。
(4)        加1.5ml5mol/LNaCl,混匀。
(5)        加1.5mCTAB/NaCl溶液,混匀,65℃保温20分钟。
(6)        用等体积酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)抽提,12000rpm离心10分钟,将上清液移至干净离心管。
(7)        用等体积异戊醇:氯仿(1:24)抽提,12000rmp离心10分钟,取上清液移至干净管中。
(8)        加入0.6-1倍体积异丙醇,-20℃静置30min.
(9)        12000rpm离心10min弃上清。
(10)将沉淀悬浮于10ml超纯水中。
(11)加入RNase,37℃水浴30min.
(12)加入等体积饱和酚/氯仿/异戊醇(25:24:1),上下颠倒数次混匀。
(13)12000rpm离心10min,吸取上相液体。
(14)加入等体积饱和氯仿/异戊醇(24:1),上下颠倒数次混匀。
(15)12000rpm离心10min,吸取上相液体。
(16)加入1/10体积3M NaAc,在加入2倍体积预冷的无水乙醇,-20℃放置30min.
(17)12000rpm离心15min,弃上清,用70%的乙醇洗涤沉淀。
(18)自然风干后,加入1-2mlTE或者超纯水溶解DNA。
(19)紫外分光光度计测定OD235,OD260和OD280,以判定提取的基因组DNA的纯度和浓度。
Rosalei.....
9楼2010-08-05 09:12:37
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louli

铜虫 (小有名气)

★ ★ ★
ffrc(金币+1):谢谢参与
reasonspare(金币+2):谢谢分享。 2010-08-05 06:05:32
引用回帖:
Originally posted by ffrc at 2010-08-04 21:45:11:
请高手赐教以下问题。
我提DNA过程中,先后用裂解液、饱和酚、酚仿醇(25:24:1)、氯仿、酒精、75%酒精。最后用TE溶解。
此过程没有用RNase。
这个过程提取下来的DNA有RNA干扰,有蛋白残留。
请问如何将这个粗 ...

加完裂解液之后,水浴65°一个小时,降至室温,加入5微升的RNAse,如果蛋白含量高,加饱和酚抽提,然后加入等体积的氯仿异戊醇(24:1),离心,取上清,加十分之一体积的乙酸钠和等体积的异丙醇,离心10min。用76%的乙醇离心5min洗涤,再用70%的乙醇洗涤,晾干,一般用水溶解。
2楼2010-08-04 22:25:00
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hustxiong

木虫 (正式写手)


ffrc(金币+1):谢谢参与
要看看 你用的是什么裂解液了,CTAB,SDS 等都是PCR抑制剂,彻底清除需要相应试剂的剂量把握,比如用醋酸钾除SDS。
建议  购买DNA纯化试剂盒,这样后续试验会顺利很多,国产的 一般不会太贵,效果都还不错。原理就是通过硅胶柱吸附后, 再洗脱。
3楼2010-08-04 22:38:43
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accident1256

铜虫 (小有名气)


ffrc(金币+1):谢谢参与
看试剂盒的说明书~~
人各有命~
4楼2010-08-04 22:45:21
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