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zhangwuhui

铜虫 (小有名气)

[交流] 【求助/交流】基因克隆实验为非目的片段? 已有16人参与

克隆实验问题
1、以cDNA为模板做PCR反应,得到的产物和预期的长度一样。
2、再用pMD-19载体连接目的片段,之后液体LB(含氨苄)200转震荡培养1-2小时,取300微升倒在LB平板培养24小时左右,以阳性菌落长到直径1-2毫米为止;再挑3-5个阳性单克隆放大培养24小时左右。
3、裂解菌体,4°C ,12 000 g ,离心20-30分钟,得到质粒。
4、PCR检测所得质粒(引物为M13-47, RV-M),得到了目的片段大小的产物(稍长些)。
5、送质粒测序(使用通用引物M13-47),但是测序结果却是如下其概况:在载体插入点之间的序列BLAST后,显示为杆菌等细菌的片段,共送了10个样品均是如此(本实验应该是动物的序列),看来不是空载,难道是载体连接上了细菌的一段序列,为什么会插入细菌片段呢,而且长度就这么巧!还是其他什么原因呢,恳请赐教!

[ Last edited by zhangwuhui on 2010-7-29 at 18:31 ]
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canon-ph

铜虫 (小有名气)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
测序时的菌污染了吧 一般后面验证时大小不对 测序就不对了 重新做 小心污染  就好了
6楼2010-07-27 11:00:13
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