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wxf3454552

金虫 (著名写手)

[交流] 【求助】蛋白质建模没有同源模板怎么解决? 已有5人参与

需要得到蛋白质三维结构 但是没有搜索到可用的同源模板  只知道一级序列
这种情况下应该怎么办?麻烦各位指点迷津。
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zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手


wxf3454552(金币+2): 2010-07-21 10:16:47
雪狼乖乖(金币+1):谢谢 2010-07-21 10:27:57
引用回帖:
Originally posted by lowen212 at 2010-07-21 09:06:12:

恩 通过 BLAST在 PDB数据库里面搜的    swiss-model 也试过  还有别的更有效的方法么

呵呵~第一种就是最有效的方法了~如果没有那应该是真没有了~哈哈~你就尝试thread法吧~
9楼2010-07-21 09:54:37
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zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手

★ ★
wxf3454552(金币+1):谢谢参与
雪狼乖乖(金币+1):谢谢 2010-07-21 07:43:35
引用回帖:
Originally posted by wxf3454552 at 2010-07-20 17:00:35:
需要得到蛋白质三维结构 但是没有搜索到可用的同源模板  只知道一级序列
这种情况下应该怎么办?麻烦各位指点迷津。

改用thread法~这种方法适合同源性小于30%的模板,如果再小,可以尝试从头构建,上网找ROSETTA软件的在线版 ~这个可以在线构建模型~是华盛顿大学的~
2楼2010-07-20 22:08:29
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tjegg

铁杆木虫 (著名写手)

★ ★ ★
wxf3454552(金币+1):谢谢参与
lei0736(金币+2):谢谢 2010-07-21 09:21:40
给你一个网址,在上面试试。http://nihserver.mbi.ucla.edu/SAVS/

[ Last edited by tjegg on 2010-7-21 at 08:26 ]
除了你的亲人,没有人应该对你好,对你好的人,一定要珍惜。
3楼2010-07-21 08:25:28
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zh1987hs

金虫 (著名写手)

分子模拟新手

引用回帖:
Originally posted by tjegg at 2010-07-21 08:25:28:
给你一个网址,在上面试试。http://nihserver.mbi.ucla.edu/SAVS/

[ Last edited by tjegg on 2010-7-21 at 08:26 ]

楼上给的这个网址不是蛋白质结构评价的网址吗?
4楼2010-07-21 08:37:08
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