应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » Gromacs/Amber/NAMD » 【求助】有没有dna库啊？
51/1返回列表
查看: 1425  |  回复: 12
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

574384607

银虫 (小有名气)

[交流] 【求助】有没有dna库啊？ 已有3人参与

大家好，我现在想用dna链，可以从哪里下到啊？就像蛋白质从pdb数据库里下一样，要是有的话，给发个链接过来吧
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2010-07-13 08:12:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

574384607

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by zhuhongaaa at 2010-08-05 09:17:23:

amber
tinker都可以做到。
贴个我自己写的教程吧
http://zhuhong.freetzi.com/wordpress/?p=52

[ Last edited by zhuhongaaa on 2010-8-5 at 09:19 ]

大侠，你好，麻烦你了
我昨天下了个tinker（window的压缩包），解压的时候没有提示安装啊，解压直接是这样的情况了
里面没有别的东西，我是指的力场文件
我用它的时候，就从tinker网页的Force Field Parameter Sets里下了个charmm22.prm 力场，直接双击发现能打开nucleic.exe，然后输入如下：

其中你说的“从5′依次输入碱基”，这个5‘和3’是什么意思啊？
结果得到三个文件


以前没用过这款软件，不知道错误和怎么处理，还请大侠指教啊
赞一下 回复此楼
9楼2010-08-06 17:31:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 13 个回答

zhuhongaaa

金虫 (正式写手)
★ ★
ghcacj(金币+2):谢谢 2010-07-16 18:06:53
574384607(金币+2): 2010-07-16 22:57:10
对于标准双链DNA，自己创建。特殊结构去PDB库或者NDB库
赞一下(1人) 回复此楼
分子模拟的主页http://varmilion.tk/
2楼2010-07-16 17:34:06
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

574384607

银虫 (小有名气)
引用回帖:
Originally posted by zhuhongaaa at 2010-07-16 17:34:06:
对于标准双链DNA，自己创建。特殊结构去PDB库或者NDB库

我不是专门做到dna的，不过现在想建个体系，用到dna，要想获得一定碱基数（不用太多10-20个就可以），单链和双链的，一般可以通过哪些途径获得，或哪些软件网页生成哪？
赞一下 回复此楼
3楼2010-08-04 10:59:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhixuec

木虫 (著名写手)
★ ★
lei0736(金币+2):谢谢 2010-08-04 14:42:10
DNA文库一般要自己构建的，或者你实验室已经构建过的，你可以直接拿过来用

不知道你是用于什么目的的，说的不是太清楚，你可以根据实验目的人工合成DNA双链
赞一下(1人) 回复此楼
酷爱の族
4楼2010-08-04 11:21:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 13 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 297，工科调剂?河南农业大学本科 +15 河南农业大学-能 2026-04-14 15/750 2026-04-20 12:39 by Equinoxhua
[考研] 求计算机方向调剂 +3 Toffee2 2026-04-16 6/300 2026-04-19 22:37 by ll叶
[考研] 297，工科调剂? +11 河南农业大学-能 2026-04-14 11/550 2026-04-19 20:07 by Equinoxhua
[考博] 申博自荐 +4 Linxia林夏 2026-04-13 4/200 2026-04-19 19:55 by Equinoxhua
[考研] 291求调剂 +11 关忆北. 2026-04-14 11/550 2026-04-19 17:16 by 中豫男
[考研] 求调剂推荐 +9 小聂爱学习 2026-04-14 9/450 2026-04-19 17:03 by 中豫男
[考研] 085404 22408 309分求调剂 +10 lzmk 2026-04-14 11/550 2026-04-19 16:42 by 中豫男
[论文投稿] 有没有接收比较快的sci期刊呀，最好在一个月之内的，研三孩子求毕业 20+4 之护着 2026-04-16 6/300 2026-04-19 13:00 by Aaron_zyn
[考研] 307中医考研调剂 +9 于以采蘩 2026-04-14 9/450 2026-04-19 08:41 by 烟雨流涯
[考研] 300求调剂 +12 橙a777 2026-04-15 12/600 2026-04-18 23:51 by 路病情
[考研] 260求调剂 +4 Zyt1314520.. 2026-04-17 5/250 2026-04-18 08:28 by babysonlkd
[有机交流] 二苯甲酮酸类衍生物 50+3 小白爱主人 2026-04-17 6/300 2026-04-17 18:47 by kf2781974
[考研] 一志愿中科大材料与化工，353分还有调剂学校吗 +10 否极泰来2026 2026-04-15 12/600 2026-04-17 17:54 by mapenggao
[考研] 295分求调剂 +5 ?要上岸? 2026-04-17 5/250 2026-04-17 16:51 by fenglj492
[考研] 322求调剂 +6 tekuzu 2026-04-17 6/300 2026-04-17 13:48 by Espannnnnol
[考研] 一志愿沪9，生物学326求调剂 +9 刘墨墨 2026-04-15 9/450 2026-04-16 17:14 by 崔崔崔cccc
[考研] 求调剂学校 +14 不会吃肉 2026-04-13 16/800 2026-04-15 21:59 by noqvsozv
[考研] 297工科调剂? +14 河南农业大学-能 2026-04-13 15/750 2026-04-15 13:25 by 黑科技矿业
[考研] 245求调剂 +6 冰糖橘?汽水 2026-04-13 10/500 2026-04-14 10:49 by jyl0317
[考研] 085600材料与化工329分求调剂 +24 叶zilin 2026-04-13 25/1250 2026-04-14 09:20 by 试管破裂
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭