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julia0708

木虫 (正式写手)

[交流] 【求助/交流】关于质粒构建与表达的问题 已有12人参与

本人是化学的,实验室最近申请到了一个生物方面的课题,所以有很多的问题都弄不懂,需要向大家请教一下。先谢过大家了。

按照课题的设想,我们需要先得到一种蛋白,然后在体外做它和一些配体的相互作用。所以现在问题的难点是在蛋白的获得的身上。
目前我们想到的方法是通过构建质粒然后进行表达来获得。
但是在构建的时候又有了一些问题。
大概整理了一下,如下:
首先,我们的蛋白是在人和哺乳动物中存在的蛋白,如果要获得这种蛋白,是不是用最常用的大肠杆菌表达系统无法获得有活性的蛋白?
其次,我们的目的是为了考察蛋白和配体的结合情况,如果这样的话,是不是只要能够保证其蛋白LBD区域的活性就可以了呢?看到有文献报道在大肠杆菌系统中表达了该蛋白的LBD的部分,这个是不是就可以达到我们的目的呢?这样的蛋白是不是具有活性的蛋白?

另外,还有个问题想问一下,如果已知蛋白的氨基酸序列,是否可以用序列合成仪来合成蛋白?这样的蛋白能否保证活性呢?和之前通过质粒构建表达的方法相比,两者所需要的成本哪个更高一些?

很多问题不是很懂,说出来也很混乱,希望大家能帮忙解答下,谢谢大家!
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silicare

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julia0708(金币+1):谢谢参与
这也能申请到啊~
2楼2010-05-12 17:38:43
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wordsworth3180

木虫 (正式写手)


julia0708(金币+1):谢谢参与
真核细胞的蛋白在大肠杆菌中表达好像会遇到不同情况吧。不是专家,帮顶!
3楼2010-05-12 20:01:03
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biogefart

木虫 (著名写手)

★ ★ ★ ★ ★ ★
julia0708(金币+1):谢谢参与
scelab(金币+5):热心虫友,欢迎多来交流~~~:tiger06::tiger28::tiger23: 2010-05-12 23:21:39
julia0708(金币+5):豁然开朗,非常感谢! 2010-05-13 11:16:30
简单试着回答
首先,我们的蛋白是在人和哺乳动物中存在的蛋白,如果要获得这种蛋白,是不是用最常用的大肠杆菌表达系统无法获得有活性的蛋白?
这个不一定,有时候是可以的,有时候得用别的表达系统,如真核表达系统。

其次,我们的目的是为了考察蛋白和配体的结合情况,如果这样的话,是不是只要能够保证其蛋白LBD区域的活性就可以了呢?看到有文献报道在大肠杆菌系统中表达了该蛋白的LBD的部分,这个是不是就可以达到我们的目的呢?这样的蛋白是不是具有活性的蛋白?
LBD不知道什么意思,我理解是结合区域和活性区域,只表达结合区域肯定是没有活性的,但是有结合活性。

另外,还有个问题想问一下,如果已知蛋白的氨基酸序列,是否可以用序列合成仪来合成蛋白?这样的蛋白能否保证活性呢?和之前通过质粒构建表达的方法相比,两者所需要的成本哪个更高一些?
当然全序列合成价格高,不过现在也在1万左右吧,质粒克隆 表达的话熟手只需要几百块。
闹太套
4楼2010-05-12 21:03:35
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julia0708

木虫 (正式写手)

引用回帖:
Originally posted by biogefart at 2010-05-12 21:03:35:
简单试着回答
首先,我们的蛋白是在人和哺乳动物中存在的蛋白,如果要获得这种蛋白,是不是用最常用的大肠杆菌表达系统无法获得有活性的蛋白?
这个不一定,有时候是可以的,有时候得用别的表达系统,如真核表达 ...

首先非常感谢哈!看到回答以后豁然开朗了许多
LBD是配体的结合区域 我们想要的是将蛋白固定在基底上再和配体结合 那么这样的话只要有结合活性应该就可以了的吧?
另外,还想再请问下,全序列合成的话,每次能合成多少克的蛋白呢?谢谢!
5楼2010-05-13 11:18:49
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biogefart

木虫 (著名写手)

第一个问题理论上回答是肯定的,但是还要实验验证。
sorry,看错你的问题了,我以为是全序列合成基因,全序列合成一个蛋白我觉得不太现实,价格会很高,除非你老板很有钱可以试试,合成短肽价格会低点,但是也是合成毫克级的。
闹太套
6楼2010-05-13 11:56:07
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三磷酸腺苷

铁杆木虫 (职业作家)


julia0708(金币+1):谢谢参与
啊~路过发现克隆高手~~顺路帮忙顶贴
然后呢,顺路说一下,只表达结合区是可以的,但你后面的实验要做漂亮,不然的话审稿人会问的哦~最好的话就是两种都表达。
7楼2010-05-13 13:05:14
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liyong1981

金虫 (正式写手)



julia0708(金币+1):谢谢参与
这个,回答晚了~
上面的都说完了~
8楼2010-05-13 14:11:12
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dyyu860

木虫 (小有名气)


julia0708(金币+1):谢谢参与
学习!呵呵!
9楼2010-05-13 14:17:01
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lingn

木虫 (正式写手)


julia0708(金币+1):谢谢参与
最好是表达全长的蛋白,先试原核系统,不行的话就换真核系统
全序列合成现在做的一般都是多肽,你的蛋白有多长?
10楼2010-05-13 21:25:48
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