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llzhang2012

[交流] 克隆基因全长引物设计问题已有9人参与

已知一序列全长,如何根据此序列设计引物克隆出全长,我是新手,麻烦各位详细介绍一下设计全长引物的步骤,最近实验急需,非常感谢!!!
  我以前克隆过片段,没有做过全长,引物设计的一些基本原则都已了解,但是设计全长引物一点都不懂,劳烦各位,谢谢!
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zhuifeng7000

至尊木虫 (著名写手)

★ ★ ★
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amisking(金币+2,VIP+0): 11-6 16:54
引用回帖:
Originally posted by llzhang2012 at 2009-11-6 10:17:

谢谢你的帮助,我现在设计了一对引物,上游引物是从序列第一次出现ATG的地方开始数出20个碱基,下游引物是从序列尾部ATT的地方向前数出20个碱基,我没有加酶切位点和保护碱基,因为刚接触分子生物学不久,学的东 ...

如果你只是想P出各个基因的话,这样设计就可以了。但是你P出这个基因后肯定是要研究它的功能,对它进行表达或者其他的吧。所以后面你肯定是要连到相应的载体上,对吧?如果你不设计酶切位点的话,要与目的载体连接的话就需要用平端连接,那样假阳性率会很高,并且需要判断你插入的序列的方向,因此最好还是加上与你的目的载体上相应的酶切位点。
10楼2009-11-06 16:14:26
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xiangao

金虫 (正式写手)


小木虫(金币+0.5):给个红包,谢谢回帖交流
从ATG开始设计上游引物   TAA处设计下游引物
3楼2009-11-04 16:22:43
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小白3521

金虫 (小有名气)


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引物上要加酶切位点和保护碱基
4楼2009-11-04 17:02:39
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llzhang2012

引用回帖:
Originally posted by 小白3521 at 2009-11-4 17:02:
引物上要加酶切位点和保护碱基

具体要怎样加啊?
5楼2009-11-05 15:31:25
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