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美美肉

新虫 (初入文坛)

[求助] 目的基因连接载体 已有1人参与

各位大神看看我这个目的基因和载体连接上了没有啊 么么么哒 (琼脂糖凝胶电泳)
目的基因 759bp 载体 4000bp marker200-4500 图从左往右依次是 marker 目的基因 载体 重组的质粒

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美美肉

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
1楼: Originally posted by 美美肉 at 2017-08-10 14:31:53
各位大神看看我这个目的基因和载体连接上了没有啊 么么么哒 (琼脂糖凝胶电泳)
目的基因 759bp 载体 4000bp marker200-4500 图从左往右依次是 marker 目的基因 载体 重组的质粒
...

图为这个
目的基因连接载体



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2楼2017-08-10 14:35:00
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llsskk112233

新虫 (正式写手)

请问你质粒切了多少,还有你应该也需要做转化吧,那你可以再做一个转化后的pcr来进一步验证

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3楼2017-08-10 14:51:39
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美美肉

新虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by llsskk112233 at 2017-08-10 14:51:39
请问你质粒切了多少,还有你应该也需要做转化吧,那你可以再做一个转化后的pcr来进一步验证

第三道是转化完挑菌摇菌提质粒后的结果

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4楼2017-08-10 15:38:57
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晋鹏

版主 (知名作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
1、酶有没有坏
内切酶可以找载体分别做单酶切后电泳验证
连接酶可以用单酶切的载体,割胶纯化后,让其自连。注意要作一个不加连接酶的对照。
连接酶的buffer要小心,它比较容易坏,建议买来后先10-20ul分装,用一次取一管,多余的部分都扔了,不要反复冻融。
2、感受态细胞
用已知浓度的质粒,稀释后,做转化,涂板,看菌落数来判断感受态的效率。这一步,同时把平板的问题也解决了。
3、连接比例
多做几个比例尝试,记住一点,不要怕载体不够,载体过多会严重影响连接效率的。我的经验是,取5ug载体,双酶切后,割胶纯化,溶于100ul水中,再稀释5-10倍后,取1ul用于10-20ul的连接体系。至于插入片段,根据电泳结果,如果比较浓的,就加1ul,很淡的话就加7ul,这个影响不是很大的。
4、酶切位点的问题
这个问题比较少见,主要出现在载体上的两个酶切位点是连在一起的时候,可能出现一个位点切开后,导致另一个位点的保护碱基不足而无法切开,这样的话,你要考虑不要两个酶分开切,先切难切的,再切容易切的。
在选择双酶切载体的时候,尽量选择带插入片段的质粒,这样载体的双酶切是否成功比较明确。
及时行乐,人生不留遗憾!
5楼2017-08-10 16:39:47
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enjoy大志

铜虫 (小有名气)

第二泳道应该是载体单酶切电泳图,一般验证目的片段和载体是否连接上的方法:单酶切和载体单酶切跑胶比对,连接产物4759bp,载体4kb,酶切验证无误,还需要送到公司测序,测序结果还需要进行NCBI-blast序列比对,直到100%了,才算链接成功。还望对你有帮助

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付出定有回报
6楼2017-08-11 16:50:35
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enjoy大志

铜虫 (小有名气)

连接产物的单酶切和载体单酶切进行跑胶验证

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付出定有回报
7楼2017-08-11 16:51:51
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