| 查看: 1742 | 回复: 7 | ||
yeahhanpei金虫 (正式写手)
|
[求助]
高斯优化分子固定问题 已有1人参与
|
| 一篇文章中提到优化分子without geometry relaxation,那这是怎么操作的,是在各原子后边写上-1代表固定,然后再优化么?如果是这样,一运行就会报错 |
» 猜你喜欢
KAUST(阿卜杜拉国王科技大学)MXene 器件方向博士后招聘
已经有0人回复
沙特阿拉伯阿卜杜拉国王科技大学(KAUST)电池方向博士后招聘
已经有0人回复
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有233人回复
福州大学新能源材料与工程研究院招收2026年入学博士
已经有0人回复
海南师范大学2026年博士研究生招收 (在职想提升学历人员可报考) 申请考核制
已经有0人回复
中国科学院成都山地灾害与环境研究所2026年特别研究助理(博士后)招聘启事
已经有0人回复
锂离子电池循环寿命衰减过快,求机理分析与改进思路
已经有2人回复
求博导收留
已经有5人回复
CSC & MSCA 博洛尼亚大学能源材料课题组博士/博士后招生|MSCA经费充足、排名优
已经有0人回复
德国Karlsruhe Institute of Technology招收电化学储能及联合培养CSC博士
已经有1人回复
德国Karlsruhe Institute of Technology招收电化学储能及联合培养CSC博士
已经有0人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:
关于用高斯进行二面角扭转势能的计算
已经有6人回复
高斯view怎么样固定分子的对称性进行优化?
已经有15人回复
如何固定某个二面角,优化分子其它部分?
已经有4人回复
高斯优化中怎样固定内坐标
已经有2人回复
Fe(001)表面自组装成膜分子力学计算
已经有14人回复
在进行高斯计算时如何消去虚频(转载)
已经有18人回复
【求助】能量优化、频率分析中的原子限定问题
已经有3人回复
【分享】MS晶体建模基本方法(团簇模型)
已经有36人回复

1234zou
金虫 (小有名气)
- 应助: 7 (幼儿园)
- 金币: 1941.5
- 红花: 5
- 帖子: 92
- 在线: 31.6小时
- 虫号: 2914121
- 注册: 2014-01-04
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
yeahhanpei: 金币+10 2017-08-02 14:35:17
感谢参与,应助指数 +1
yeahhanpei: 金币+10 2017-08-02 14:35:17
|
显然只能固定部分原子进行优化,你要是全部加上-1固定,那还优化个啥,全都冻住了,显然会报错。所以你要做的是看清楚文章里作者固定的是哪些原子,你也固定那些原子。 要是还不行的话,上传log文件最后的报错信息。 |
» 本帖已获得的红花(最新10朵)
2楼2017-08-02 12:39:38
yeahhanpei
金虫 (正式写手)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 321.6
- 散金: 820
- 红花: 4
- 帖子: 439
- 在线: 162.8小时
- 虫号: 4110172
- 注册: 2015-09-29
- 性别: GG
- 专业: 金属材料的合金相、相变及
送红花一朵 |
谢谢您的回答,我又看了下文章,里面说,为了保持结构不变,在without geometry relaxtion 时,获得了其分子表面静电势。那有一个问题:不优化可以得到.wfn文件么,因为要画esp图。那route是不是把opt去掉就可以了,各原子还用写-1么? 谢谢您 发自小木虫Android客户端 |

3楼2017-08-02 14:34:58
小范范1989
木虫 (著名写手)
- 应助: 123 (高中生)
- 金币: 3821.3
- 散金: 968
- 红花: 243
- 帖子: 1979
- 在线: 452.8小时
- 虫号: 2013403
- 注册: 2012-09-19
- 性别: GG
- 专业: 原子和分子物理

4楼2017-08-02 16:11:52
1234zou
金虫 (小有名气)
- 应助: 7 (幼儿园)
- 金币: 1941.5
- 红花: 5
- 帖子: 92
- 在线: 31.6小时
- 虫号: 2914121
- 注册: 2014-01-04
- 性别: GG
- 专业: 理论和计算化学
5楼2017-08-02 18:22:27
yeahhanpei
金虫 (正式写手)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 321.6
- 散金: 820
- 红花: 4
- 帖子: 439
- 在线: 162.8小时
- 虫号: 4110172
- 注册: 2015-09-29
- 性别: GG
- 专业: 金属材料的合金相、相变及

6楼2017-08-03 00:13:59
yeahhanpei
金虫 (正式写手)
- 应助: 2 (幼儿园)
- 金币: 321.6
- 散金: 820
- 红花: 4
- 帖子: 439
- 在线: 162.8小时
- 虫号: 4110172
- 注册: 2015-09-29
- 性别: GG
- 专业: 金属材料的合金相、相变及

7楼2017-08-03 00:14:22
小范范1989
木虫 (著名写手)
- 应助: 123 (高中生)
- 金币: 3821.3
- 散金: 968
- 红花: 243
- 帖子: 1979
- 在线: 452.8小时
- 虫号: 2013403
- 注册: 2012-09-19
- 性别: GG
- 专业: 原子和分子物理

8楼2017-08-03 07:48:07













回复此楼