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yeahhanpei金虫 (正式写手)
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高斯优化分子固定问题 已有1人参与
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| 一篇文章中提到优化分子without geometry relaxation,那这是怎么操作的,是在各原子后边写上-1代表固定,然后再优化么?如果是这样,一运行就会报错 |
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1234zou
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【答案】应助回帖
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感谢参与,应助指数 +1
yeahhanpei: 金币+10 2017-08-02 14:35:17
感谢参与,应助指数 +1
yeahhanpei: 金币+10 2017-08-02 14:35:17
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显然只能固定部分原子进行优化,你要是全部加上-1固定,那还优化个啥,全都冻住了,显然会报错。所以你要做的是看清楚文章里作者固定的是哪些原子,你也固定那些原子。 要是还不行的话,上传log文件最后的报错信息。 |
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2楼2017-08-02 12:39:38
yeahhanpei
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送红花一朵 |
谢谢您的回答,我又看了下文章,里面说,为了保持结构不变,在without geometry relaxtion 时,获得了其分子表面静电势。那有一个问题:不优化可以得到.wfn文件么,因为要画esp图。那route是不是把opt去掉就可以了,各原子还用写-1么? 谢谢您 发自小木虫Android客户端 |

3楼2017-08-02 14:34:58
小范范1989
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6楼2017-08-03 00:13:59
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7楼2017-08-03 00:14:22
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8楼2017-08-03 07:48:07










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