| 查看: 1461 | 回复: 4 | |||
[求助]
如何固定某个二面角，优化分子其它部分？ 已有1人参与
|
|
关于高斯优化有两个问题： 1.给定一个分子，想固定其中某个二面角，优化分子的其它部分，应该用什么命令实现？ 2.进一步的一个问题：假如想扫描某个二面角的势能面，其它部分优化，就是scan一个relaxed PES，应该如何实现？ 目前我只会硬扫二面角势能面，举例如下： # B3LYP/3-21G opt=modredundant molecule 0 1 A x,y,z B x,y,z C x,y,z D x,y,z D 1 2 3 4 += 0.000000 S 7 30.000000 这样就能实现分子中二面角ABCD 从0到180度，步长为30度的势能面。除了二面角，其余部分不优化。 现在求软扫的方法？请高人指点！ |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 经验 |
» 猜你喜欢
Tc数据拟合
已经有1人回复
-
寻求物理化学学报最新的投稿模板！
已经有4人回复
-
物理化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有83人回复
-
韩国釜山大学储能电池与功能材料实验室诚招博后（电池/电化学/器件制备/MOF合成）
已经有187人回复
-
祈福！
已经有79人回复
-
投稿咨询
已经有7人回复
-
自科面上 散金币 祈福
已经有61人回复
-
散金求好运
已经有315人回复
-
博士生招生, 材料模拟方向，University of South Carolina
已经有0人回复
-
Postdoc position, materials simulations/machine learning, U. of South Carolina
已经有0人回复
-
祈福青基
已经有34人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 如何修改从Gaussview得到的分子中特定原子的颜色
已经有11人回复
- 含双键二面角，柔性扫描势能曲线，计算到一半就出错（gaussian）
已经有8人回复
- 体系中有很多水分子，如何用rattle命令限制水分子的类型和键长键角
已经有14人回复
- 如何标出Gauss09计算输出文件中两原子之间的距离（键长）和键角等数据？
已经有11人回复
- 高斯计算中固定部分角度作优化
已经有10人回复
- GaussView中的二面角是怎么定义的？
已经有5人回复
- 固定键长优化问题
已经有7人回复
- 做scan时怎么保持两个原子间键长不变
已经有7人回复
- 固定一个键长的同时 扫描二面角？
已经有11人回复
- 如何 用高斯 固定部分原子 进行优化
已经有4人回复
- TiO2（101）晶面的优化
已经有13人回复
- 【求助】键长键角等固定后的优化..悬赏30...【已经解决～感谢～】
已经有22人回复
- 【求助】gaussian view画图时键长怎么调整
已经有10人回复
- 【求助】加了虚原子要怎么固定键长优化
已经有14人回复
- 【求助】请问一下哪个软件可以像Gaussview那样调整键长、键角和二面角？
已经有4人回复
- 【求助】Materials studio 5.0在做优化时能不能固定部分原子坐标？
已经有4人回复
- 【求助】关于dmol中部分原子固定的几何优化问题
已经有10人回复
fatpig8832
铁杆木虫 (著名写手)
- 应助: 16 (小学生)
- 金币: 7420.2
- 散金: 31
- 红花: 28
- 帖子: 1438
- 在线: 610.9小时
- 虫号: 770403
- 注册: 2009-05-14
2楼2014-11-28 12:01:32
jingfuqiang
银虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 376.6
- 帖子: 94
- 在线: 92.4小时
- 虫号: 2576417
- 注册: 2013-08-01
- 性别: GG
- 专业: 化学动力学
3楼2014-11-28 21:17:59
4楼2014-11-28 21:20:46
lastzealot
新虫 (著名写手)
【乱世的奸雄】
- 应助: 87 (初中生)
- 金币: 2684.9
- 散金: 876
- 红花: 24
- 帖子: 2920
- 在线: 212.3小时
- 虫号: 730090
- 注册: 2009-03-24
- 性别: GG
- 专业: 高分子材料结构与性能
5楼2015-04-16 17:47:28
20