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mengsk

金虫 (著名写手)

[求助] 如何固定某个二面角,优化分子其它部分? 已有1人参与

关于高斯优化有两个问题:
1.给定一个分子,想固定其中某个二面角,优化分子的其它部分,应该用什么命令实现?
2.进一步的一个问题:假如想扫描某个二面角的势能面,其它部分优化,就是scan一个relaxed PES,应该如何实现?

目前我只会硬扫二面角势能面,举例如下:
# B3LYP/3-21G opt=modredundant

molecule

0 1
A     x,y,z
B     x,y,z
C     x,y,z
D     x,y,z

D 1 2 3 4 += 0.000000 S 7 30.000000

这样就能实现分子中二面角ABCD 从0到180度,步长为30度的势能面。除了二面角,其余部分不优化。

现在求软扫的方法?请高人指点!
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奋斗中的小木虫
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fatpig8832

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
mengsk: 金币+10, ★★★★★最佳答案, 果然是啊,非常感谢 2014-11-28 12:06:39
你这就是软扫啊...仔细看看output file,确认是不是其他的变量都已经优化了。

硬扫貌似是用 scan 命令的...
2楼2014-11-28 12:01:32
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jingfuqiang

银虫 (小有名气)

冻结一下
上善若水!
3楼2014-11-28 21:17:59
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mengsk

金虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by jingfuqiang at 2014-11-28 21:17:59
冻结一下

请说得详细一些哈!
奋斗中的小木虫
4楼2014-11-28 21:20:46
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lastzealot

新虫 (著名写手)

【乱世的奸雄】

引用回帖:
4楼: Originally posted by mengsk at 2014-11-28 21:20:46
请说得详细一些哈!

gview-edit-atomlist-edit-z-matrix-standardize-modredundant-把要固定的参数加进去
保存时把cartesian前的勾删掉
计算即可
5楼2015-04-16 17:47:28
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