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yeahhanpei金虫 (正式写手)
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高斯优化分子固定问题 已有1人参与
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| 一篇文章中提到优化分子without geometry relaxation，那这是怎么操作的，是在各原子后边写上-1代表固定，然后再优化么?如果是这样，一运行就会报错 |
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1234zou
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5楼2017-08-02 18:22:27
1234zou
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【答案】应助回帖
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yeahhanpei: 金币+10 2017-08-02 14:35:17
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yeahhanpei: 金币+10 2017-08-02 14:35:17
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显然只能固定部分原子进行优化，你要是全部加上-1固定，那还优化个啥，全都冻住了，显然会报错。所以你要做的是看清楚文章里作者固定的是哪些原子，你也固定那些原子。 要是还不行的话，上传log文件最后的报错信息。 |
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2楼2017-08-02 12:39:38
yeahhanpei
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谢谢您的回答，我又看了下文章，里面说，为了保持结构不变，在without geometry relaxtion 时，获得了其分子表面静电势。那有一个问题:不优化可以得到.wfn文件么，因为要画esp图。那route是不是把opt去掉就可以了，各原子还用写-1么？ 谢谢您 发自小木虫Android客户端 |
3楼2017-08-02 14:34:58
小范范1989
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4楼2017-08-02 16:11:52